RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616306.1

UBXN8-208, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN8, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-208ENST00000616306 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.18□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 THAP6Q8TBB0 222 aa7.18□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 LINC01587Q99440 93 aa7.18□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 PRELID1Q9Y255 219 aa7.18□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 PRAC2D3DTV9 90 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 H7BYZ3 331 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 MPC2O95563 127 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 AZU1P20160 251 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 CLINT1Q14677 625 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 C16orf74Q96GX8 76 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 NDUFB4O95168 129 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 PRM2P04554 102 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 HTN3P15516 51 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 LEPP41159 167 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 ATP5SQ99766 215 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 HSPB11Q9Y547 144 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 CBY3A6NI87 242 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 M0R3E3 92 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 CT45A10P0DMU9 189 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 DEFB130BP0DP73 79 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 DEFB130AP0DP74 79 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 PYYP10082 97 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 HTN1P15515 57 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 LINC00477Q96M19 166 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 OR51M1Q9H341 326 aa7.15□□□□□ -1.26
UBXN8-208ENST00000616306 IFNA5P01569 189 aa7.14□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 ATP5G1P05496 136 aa7.14□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 ATP5G3P48201 142 aa7.14□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 RNF212Q495C1 297 aa7.14□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.14□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.14□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 Q6ZSN1 163 aa7.14□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.14□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.14□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 BLNKQ8WV28 456 aa7.14□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.14□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 FUT9Q9Y231 359 aa7.14□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 PTTG1O95997 202 aa7.13□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 NMBP08949 121 aa7.13□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 FCN2Q15485 313 aa7.13□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.13□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.13□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.13□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 FXYD5Q96DB9 178 aa7.13□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.13□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 PAXXQ9BUH6 204 aa7.13□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.13□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 MBD2Q9UBB5 411 aa7.13□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 NACAE9PAV3 2078 aa7.12□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.12□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 C7orf71A4D174 169 aa7.12□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 KLLNB2CW77 178 aa7.12□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 SLPIP03973 132 aa7.12□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 CRISP2P16562 243 aa7.12□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 ERCC8Q13216 396 aa7.12□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.12□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.12□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.12□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.12□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.12□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 ALG5Q9Y673 324 aa7.12□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.12□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.12□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.11□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.11□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 SNURFLB1AK76 121 aa7.11□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 F5H768 121 aa7.11□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 J3KRW8 73 aa7.11□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 OR7C2O60412 319 aa7.11□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 OR10J4P0C629 311 aa7.11□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 TAS2R45P59539 299 aa7.11□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.11□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 KHDC3LQ587J8 217 aa7.11□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.11□□□□□ -1.27
UBXN8-208ENST00000616306 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms