RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608647.5

LINC00635-220, long intergenic non-protein coding RNA 635, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00635, Length 561 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00635-220ENST00000608647 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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LINC00635-220ENST00000608647 NMBP08949 121 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00635-220ENST00000608647 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
LINC00635-220ENST00000608647 LEPP41159 167 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00635-220ENST00000608647 HAGHQ16775 308 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00635-220ENST00000608647 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00635-220ENST00000608647 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00635-220ENST00000608647 SSX7Q7RTT5 188 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00635-220ENST00000608647 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00635-220ENST00000608647 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00635-220ENST00000608647 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00635-220ENST00000608647 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00635-220ENST00000608647 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00635-220ENST00000608647 PGPA6NDG6 321 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00635-220ENST00000608647 DIRC3C9JPN6 131 aa6.59□□□□□ -1.35
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LINC00635-220ENST00000608647 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00635-220ENST00000608647 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00635-220ENST00000608647 RCHY1Q96PM5 261 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00635-220ENST00000608647 ATG101Q9BSB4 218 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00635-220ENST00000608647 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00635-220ENST00000608647 COL7A1Q02388 2944 aa6.59□□□□□ -1.36
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LINC00635-220ENST00000608647 GGTLC3B5MD39 225 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
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LINC00635-220ENST00000608647 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 HLA-DMBP28068 263 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 CDKN1BP46527 198 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 ZNF138P52744 262 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 RNF183Q96D59 192 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 F6UB75 175 aa6.57□□□□□ -1.36
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LINC00635-220ENST00000608647 PDE6DO43924 150 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 CRISP2P16562 243 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 CST9LP1Q5W188 147 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 AMTNQ6UX39 209 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.57□□□□□ -1.36
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LINC00635-220ENST00000608647 PEX7O00628 323 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 IGKV3-20P01619 116 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 BCL2P10415 239 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 MIFP14174 115 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 UBE2G2P60604 165 aa6.56□□□□□ -1.36
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LINC00635-220ENST00000608647 UBE2G1P62253 170 aa6.56□□□□□ -1.36
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LINC00635-220ENST00000608647 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 FMC1Q96HJ9 113 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 NEU1Q99519 415 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 ZNF492Q9P255 531 aa6.56□□□□□ -1.36
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LINC00635-220ENST00000608647 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 TMEM189A5PLL7 270 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 PRAC2D3DTV9 90 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 RGS13O14921 159 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 PAGE4O60829 102 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 AKR1C3P42330 323 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 XCL2Q9UBD3 114 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 VAX2Q9UIW0 290 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 U3KQK5 164 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 A0A1B0GV50 99 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00635-220ENST00000608647 C7orf71A4D174 169 aa6.54□□□□□ -1.36
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