RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR4C46A6NHA9 309 aa9.1□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ORM1P02763 201 aa9.1□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPIFP30405 207 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LY6EQ16553 131 aa9.1□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIFOQ8TCI5 191 aa9.1□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MSRB1Q9NZV6 116 aa9.1□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 hDV102S1A0JD36 115 aa9.1□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMKR1H3BMG3 65 aa9.1□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GOSR1O95249 250 aa9.1□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa9.1□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa9.1□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.09□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa9.09□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PAX8Q06710 450 aa9.09□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TWIST1Q15672 202 aa9.09□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IL17RELQ6ZVW7 336 aa9.09□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.09□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SELENOKQ9Y6D0 94 aa9.09□□□□□ -0.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 M0QZK8 103 aa9.08□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q6ZQT7 251 aa9.08□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KLHDC1Q8N7A1 406 aa9.08□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STPG4Q8N801 248 aa9.08□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRBV12-3P01733 135 aa9.08□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSPOP30536 169 aa9.08□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q6AWC8 147 aa9.08□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa9.08□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MXRA5Q9NR99 2828 aa9.08□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FBN2P35556 2912 aa9.08□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa9.08□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CRXO43186 299 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NCR2O95944 276 aa9.08□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV1-69P01742 117 aa9.08□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.08□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LCNL1Q6ZST4 164 aa9.08□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.08□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NRGNQ92686 78 aa9.08□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCL19Q99731 98 aa9.08□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa9.08□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TLN2Q9Y4G6 2542 aa9.08□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAV41A0A0B4J266 112 aa9.07□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GAS8-AS1O95177 125 aa9.07□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATP5G2Q06055 141 aa9.07□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF493Q6ZR52 646 aa9.07□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FA2HQ7L5A8 372 aa9.07□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 USP24Q9UPU5 2620 aa9.07□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa9.07□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR5AL1P0C617 328 aa9.07□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q6ZS46 218 aa9.07□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRELID3AQ96N28 172 aa9.07□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa9.07□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SORL1Q92673 2214 aa9.06□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.06□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRGV3P03979 118 aa9.06□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATP5J2P56134 94 aa9.06□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q6ZVH6 145 aa9.06□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COX8CQ7Z4L0 72 aa9.06□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GATD1Q8NB37 220 aa9.06□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM190Q8WZ59 177 aa9.06□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 METTL26Q96S19 204 aa9.06□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.06□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.06□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MOB4Q9Y3A3 225 aa9.06□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1B0GW15 77 aa9.06□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV3-11P01762 117 aa9.06□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BMI1P35226 326 aa9.06□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa9.06□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EPG5Q9HCE0 2579 aa9.05□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A096LNJ9 63 aa9.05□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa9.05□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FABP5P3A8MUU1 101 aa9.05□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEFB1P60022 68 aa9.05□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BLCAPP62952 87 aa9.05□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C8orf86Q6ZUL3 223 aa9.05□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIMREGQ9BSJ6 248 aa9.05□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM208Q9BTX3 173 aa9.05□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.05□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGLC6P0CF74 106 aa9.05□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ORMDL3Q8N138 153 aa9.05□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C10orf105Q8TEF2 133 aa9.05□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KLK15Q9H2R5 256 aa9.05□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYO9AB2RTY4 2548 aa9.05□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H3BUX3 64 aa9.04□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NPYP01303 97 aa9.04□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CKS2P33552 79 aa9.04□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KLK9Q2XQG4 91 aa9.04□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF747Q9BV97 191 aa9.04□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KLK9Q9UKQ9 250 aa9.04□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CUBNO60494 3623 aa9.04□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A087X0K7 114 aa9.04□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 J3KRW8 73 aa9.04□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa9.04□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRSS57Q6UWY2 283 aa9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms