RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-218	ENST00000584243	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GGA3-218	ENST00000584243		Q8N6K4	173 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GGA3-218	ENST00000584243	NUP35	Q8NFH5	326 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GGA3-218	ENST00000584243	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
GGA3-218	ENST00000584243	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GGA3-218	ENST00000584243	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GGA3-218	ENST00000584243	GNB4	Q9HAV0	340 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GGA3-218	ENST00000584243	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GGA3-218	ENST00000584243	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GGA3-218	ENST00000584243	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GGA3-218	ENST00000584243	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243		A0A1B0GUT8	65 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	MSMB	P08118	114 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	TMEM11	P17152	192 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	PROK1	P58294	105 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	HES1	Q14469	280 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	PSG3	Q16557	428 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	MLANA	Q16655	118 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	BLNK	Q8WV28	456 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	RABAC1	Q9UI14	185 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	DIRC3	C9JPN6	131 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243		H3BUA1	57 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	IL4	P05112	153 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	KRTAP10-11	P60412	298 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	NRN1	Q9NPD7	142 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243		A0A087X0K7	114 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243		A0A1W2PS18	150 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	FAM223B	A6NKX1	122 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	TOX4	O94842	621 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	PPBP	P02775	128 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	ARF6	P62330	175 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243		Q56UQ5	140 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	MORN5	Q5VZ52	161 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	PRR27	Q6MZM9	219 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243		Q6ZWC4	215 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF580	Q9UK33	172 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	DNAH2	Q9P225	4427 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243		F2Z2F3	143 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243		M0R2Z0	102 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	NDUFA7	O95182	113 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	GATA3	P23771	443 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	TCL1A	P56279	114 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	KRTDAP	P60985	99 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	RITA1	Q96K30	269 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	SIRPD	Q9H106	197 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	ST20	Q9HBF5	79 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	PSG8	Q9UQ74	426 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	RNF213	Q63HN8	5207 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243		A0A1W2PRD5	423 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GGA3-218	ENST00000584243		A0A1W2PRF3	423 aa		6.23	□□□□□ -1.41

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