RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583328.5

TOP3A-215, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3A, Length 727 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-215ENST00000583328 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.56□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.56□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 PFDN1O60925 122 aa8.55□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 INSP01308 110 aa8.55□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 TSPOP30536 169 aa8.55□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 MEOX2P50222 304 aa8.55□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 SERF2P84101 59 aa8.55□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 ZFP69Q49AA0 526 aa8.55□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.55□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 MORN5Q5VZ52 161 aa8.55□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 AMTNQ6UX39 209 aa8.55□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 TMUB2Q71RG4 321 aa8.55□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.55□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.55□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 FRZBQ92765 325 aa8.55□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 C20orf173Q96LM9 149 aa8.55□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 Q9H3A6 140 aa8.55□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 A0A087X0K7 114 aa8.54□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 A8MTW9 85 aa8.54□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 M0R2Z0 102 aa8.54□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 AZU1P20160 251 aa8.54□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 M6PRP20645 277 aa8.54□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 RHOBP62745 196 aa8.54□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.54□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.54□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 FUT9Q9Y231 359 aa8.54□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.53□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 A0A1W2PPQ1 181 aa8.53□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.53□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 MBP02144 154 aa8.53□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 OR5I1Q13606 314 aa8.53□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 Q5VSD8 79 aa8.53□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.53□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.53□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 LINC01587Q99440 93 aa8.53□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.53□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.53□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.53□□□□□ -1.04
TOP3A-215ENST00000583328 HTN1P15515 57 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 CNN1P51911 297 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 XGP55808 180 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 RAB2AP61019 212 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 LCN15Q6UWW0 184 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 BAP18Q8IXM2 172 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 C9orf62Q8N4C0 152 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 C17orf77Q96MU5 243 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 A0A1W2PPV4 95 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 EREGO14944 169 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 IGLC2P0DOY2 106 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 TAS2R45P59539 299 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 GUK1Q16774 197 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 ESRGQ1W209 222 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 KHDC3LQ587J8 217 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 STOML3Q8TAV4 291 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 UPK3BQ9BT76 320 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 FAT1Q14517 4588 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 A0A0J9YY99 117 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 OR7C2O60412 319 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 SEC11BP0C7V7 166 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 TAS2R60P59551 318 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 C16orf74Q96GX8 76 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 C18orf15Q96N68 181 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 OR51M1Q9H341 326 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 H3BQ15 152 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 ZNF253O75346 499 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 PYYP10082 97 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 LINC00315P59091 139 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 PDE6HQ13956 83 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-215ENST00000583328 SLC51BQ86UW2 128 aa8.49□□□□□ -1.05
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