RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571386.1

SPNS2-204, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-204ENST00000571386 SNURFLB1AK76 121 aa11.74□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 F5H768 121 aa11.74□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 OR7C2O60412 319 aa11.74□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 PTTG1O95997 202 aa11.74□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 ICAM4Q14773 271 aa11.74□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 KIR3DS1Q14943 382 aa11.74□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 FCN2Q15485 313 aa11.74□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 FFAR4Q5NUL3 377 aa11.74□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa11.74□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 LINC00477Q96M19 166 aa11.74□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 PYGO2Q9BRQ0 406 aa11.74□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 SMIM3Q9BZL3 60 aa11.74□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 HSPG2P98160 4391 aa11.74□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 OR10J4P0C629 311 aa11.73□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 TAS2R45P59539 299 aa11.73□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 TMEM78Q5T7P6 136 aa11.73□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 FAM122CQ6P4D5 195 aa11.73□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 RNF141Q8WVD5 230 aa11.73□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 CSN1S1P47710 185 aa11.72□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 ERCC8Q13216 396 aa11.72□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 RNF212Q495C1 297 aa11.72□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 KHDC3LQ587J8 217 aa11.72□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa11.72□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 ALG5Q9Y673 324 aa11.72□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 C7orf71A4D174 169 aa11.71□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 GPX1P07203 203 aa11.71□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa11.71□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 FXYD5Q96DB9 178 aa11.71□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 ATG101Q9BSB4 218 aa11.71□□□□□ -0.53
SPNS2-204ENST00000571386 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 LYPD1Q8N2G4 141 aa11.7□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF680Q8NEM1 530 aa11.7□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa11.7□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 MED28Q9H204 178 aa11.7□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 KLLNB2CW77 178 aa11.69□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 M0R2N4 97 aa11.69□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 NUDT3O95989 172 aa11.69□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 NMBP08949 121 aa11.69□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 RANP62826 216 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 PHYHIPLQ96FC7 376 aa11.69□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 A0A1W2PPV4 95 aa11.68□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 PRSS29PA6NIE9 313 aa11.68□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 CRISP2P16562 243 aa11.68□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 BTN1A1Q13410 526 aa11.68□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa11.67□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 GAGE12BA1L429 117 aa11.67□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 RGS13O14921 159 aa11.67□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 GAGE7O76087 117 aa11.67□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 GAGE12FP0CL80 117 aa11.67□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 GAGE12GP0CL81 117 aa11.67□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 GAGE12IP0CL82 117 aa11.67□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF138P52744 262 aa11.67□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 CD300CQ08708 224 aa11.67□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 OR5I1Q13606 314 aa11.67□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF266Q14584 549 aa11.67□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 LGALS9BQ3B8N2 356 aa11.67□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 FAM74A1Q5RGS3 127 aa11.67□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 FAM19A4Q96LR4 140 aa11.67□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 VGLL1Q99990 258 aa11.67□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 Q9H3A6 140 aa11.67□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 M6PRP20645 277 aa11.66□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 CCL18P55774 89 aa11.66□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 SOHLH1Q5JUK2 328 aa11.66□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 CMTM2Q8TAZ6 248 aa11.66□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 RXFP4Q8TDU9 374 aa11.66□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF492Q9P255 531 aa11.66□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 TRGV2A0A075B6R0 118 aa11.65□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.65□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 RBAKDNA6NC62 111 aa11.65□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa11.65□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 PQLC2Q6ZP29 291 aa11.65□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 LINC00612Q8N6U2 182 aa11.65□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 ASB13Q8WXK3 278 aa11.65□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF503Q96F45 646 aa11.65□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 ARPC5LQ9BPX5 153 aa11.65□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 LINC00467Q9BRT7 94 aa11.65□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 WFDC1Q9HC57 220 aa11.65□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa11.65□□□□□ -0.54
SPNS2-204ENST00000571386 NACAE9PAV3 2078 aa11.64□□□□□ -0.55
SPNS2-204ENST00000571386 RTL8CO15255 209 aa11.64□□□□□ -0.55
SPNS2-204ENST00000571386 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa11.64□□□□□ -0.55
SPNS2-204ENST00000571386 Q8TAT8 98 aa11.64□□□□□ -0.55
SPNS2-204ENST00000571386 HYLS1Q96M11 299 aa11.64□□□□□ -0.55
SPNS2-204ENST00000571386 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa11.63□□□□□ -0.55
SPNS2-204ENST00000571386 RAB2AP61019 212 aa11.63□□□□□ -0.55
SPNS2-204ENST00000571386 Q6ZTI0 123 aa11.63□□□□□ -0.55
SPNS2-204ENST00000571386 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa11.63□□□□□ -0.55
SPNS2-204ENST00000571386 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SPNS2-204ENST00000571386 OR10G4Q8NGN3 311 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms