RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 ERCC8Q13216 396 aa6.81□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 C4orf46Q504U0 113 aa6.81□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.81□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.81□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.81□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.81□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 SMCO3A2RU48 225 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 C9JCJ5 164 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 H3BQ15 152 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 WRBO00258 174 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 GAS8-AS1O95177 125 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGLC2P0DOY2 106 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 PPT1P50897 306 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 SELENOTP62341 195 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 LAGE3Q14657 143 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF846Q147U1 533 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 S100A7AQ86SG5 101 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 MCFD2Q8NI22 146 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 BAALCQ8WXS3 180 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 RNF24Q9Y225 148 aa6.8□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.79□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.79□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 DISC1C4P0D8 188 aa6.79□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 H3BP45 60 aa6.79□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 RGS13O14921 159 aa6.79□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 SYNGR2O43760 224 aa6.79□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 MED6O75586 246 aa6.79□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR4E1P0C645 316 aa6.79□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 IL18Q14116 193 aa6.79□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 OPCMLQ14982 345 aa6.79□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.79□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRR9Q5T870 116 aa6.79□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q6ZRU5 148 aa6.79□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.79□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.79□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 SOSTQ9BQB4 213 aa6.79□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.79□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 M0R3E3 92 aa6.78□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 GPX1P07203 203 aa6.78□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 CRISP2P16562 243 aa6.78□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q8N3U1 123 aa6.78□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.78□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.78□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.78□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.78□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 RASL10AQ92737 203 aa6.78□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 LINC00477Q96M19 166 aa6.78□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.78□□□□□ -1.32
CTDNEP1-202ENST00000570380 RNF222A6NCQ9 220 aa6.77□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 K7EPK0 472 aa6.77□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC25A6P12236 298 aa6.77□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 SRPXP78539 464 aa6.77□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.77□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 ODF1Q14990 250 aa6.77□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.77□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRRT1Q99946 306 aa6.77□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.77□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 V9GYH0 126 aa6.77□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.76□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.76□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 FABP12A6NFH5 140 aa6.76□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 CTDSPLO15194 276 aa6.76□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 AKAIN1P0CW23 69 aa6.76□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.76□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q8N976 141 aa6.76□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.76□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 PAXXQ9BUH6 204 aa6.76□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 LPAP08519 4548 aa6.76□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.75□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.75□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 NMBP08949 121 aa6.75□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 ANXA3P12429 323 aa6.75□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 GUK1Q16774 197 aa6.75□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 LELP1Q5T871 98 aa6.75□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.75□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 GOSR2O14653 212 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 COX7A2P2O60397 106 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 PYDC2Q56P42 97 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 MUC21Q5SSG8 566 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
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