RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		6.62	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		6.61	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	SNURFL	B1AK76	121 aa		6.61	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	MPC2	O95563	127 aa		6.61	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	NUDT3	O95989	172 aa		6.61	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	PET100	P0DJ07	73 aa		6.61	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	ICAM4	Q14773	271 aa		6.61	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		6.61	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		6.61	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	HYLS1	Q96M11	299 aa		6.61	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP5S	Q99766	215 aa		6.61	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		6.61	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		6.61	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	GAGE12B	A1L429	117 aa		6.6	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	C7orf71	A4D174	169 aa		6.6	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	GAGE7	O76087	117 aa		6.6	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	IFNA5	P01569	189 aa		6.6	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	OR10J4	P0C629	311 aa		6.6	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	GAGE12F	P0CL80	117 aa		6.6	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	GAGE12G	P0CL81	117 aa		6.6	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	GAGE12I	P0CL82	117 aa		6.6	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	OR5I1	Q13606	314 aa		6.6	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		6.6	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		6.6	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	RNF141	Q8WVD5	230 aa		6.6	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	PAXX	Q9BUH6	204 aa		6.6	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	FUT9	Q9Y231	359 aa		6.6	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	HSPB11	Q9Y547	144 aa		6.6	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		6.6	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		6.59	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	KLLN	B2CW77	178 aa		6.59	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	OR7C2	O60412	319 aa		6.59	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	GPX1	P07203	203 aa		6.59	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	NMB	P08949	121 aa		6.59	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	CCL18	P55774	89 aa		6.59	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		6.59	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		6.59	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479		Q6ZR54	194 aa		6.59	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC51B	Q86UW2	128 aa		6.59	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	FXYD5	Q96DB9	178 aa		6.59	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		6.59	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		6.59	□□□□□ -1.35
KIFC3-231	ENST00000567479	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	RTL8C	O15255	209 aa		6.58	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	CRISP2	P16562	243 aa		6.58	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	CSN1S1	P47710	185 aa		6.58	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	BTN1A1	Q13410	526 aa		6.58	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		6.58	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		6.58	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		6.58	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	VGLL1	Q99990	258 aa		6.58	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		6.58	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		6.58	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF492	Q9P255	531 aa		6.58	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		6.58	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		6.57	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00862	A6NCI5	91 aa		6.57	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	IFNA7	P01567	189 aa		6.57	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF138	P52744	262 aa		6.57	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	TAS2R45	P59539	299 aa		6.57	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	RAB14	P61106	215 aa		6.57	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		6.57	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		6.57	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		6.57	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		6.57	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		6.57	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	MBD2	Q9UBB5	411 aa		6.57	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A0J9YY99	117 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1B0GVY2	172 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1W2PPV4	95 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	RBAKDN	A6NC62	111 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	HOXA5	P20719	270 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	SMUG1	Q53HV7	270 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	KHDC3L	Q587J8	217 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479		Q6ZTI0	123 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF503	Q96F45	646 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479		Q9H3A6	140 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	WFDC1	Q9HC57	220 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		6.56	□□□□□ -1.36

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