RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567320.1

CDH1-211, Transcript of cadherin 1, humanhuman

TSL 3

Gene CDH1, Length 352 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1-211ENST00000567320 LYPD5Q6UWN5 251 aa-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 OR5A2Q8NGI9 324 aa-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 DCUN1D1Q96GG9 259 aa-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 CCDC42Q96M95 316 aa-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 ZNF714Q96N38 554 aa-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 PRAP1Q96NZ9 151 aa-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 PRR15LQ9BU68 103 aa-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 CNFNQ9BYD5 112 aa-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 CST11Q9H112 138 aa-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 OTORQ9NRC9 128 aa-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 TMEM14BQ9NUH8 114 aa-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 FKBP11Q9NYL4 201 aa-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 USE1Q9NZ43 259 aa-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 VPS29Q9UBQ0 182 aa-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 SS18L2Q9UHA2 77 aa-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 MED12Q93074 2177 aa-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
CDH1-211ENST00000567320 COL6A3P12111 3177 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 BCL9LQ86UU0 1499 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 PLXNA2O75051 1894 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 PTPRGP23470 1445 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 ASXL3Q9C0F0 2248 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 UNC79Q9P2D8 2635 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 ALMS1Q8TCU4 4167 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 ABCA2Q9BZC7 2435 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 FAM25EA8MYX2 175 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 M0QX08 132 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 M0R036 132 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 TPST1O60507 370 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 HIST1H2BKO60814 126 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 GGCTO75223 188 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 CST7O76096 145 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 SERPINA1P01009 418 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 MT-ND6P03923 174 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 GYPBP06028 91 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 HIST1H2BJP06899 126 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 PYYP10082 97 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 BCL2P10415 239 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 SPRR1AP35321 89 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 CAPZBP47756 277 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 MT4P47944 62 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 AP3S2P59780 193 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 MYL6P60660 151 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 NCALDP61601 193 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 HBBP68871 147 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 MYL5Q02045 173 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 EMX2Q04743 252 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 COTL1Q14019 142 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 WFDC2Q14508 124 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 SNCBQ16143 134 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 LTC4SQ16873 150 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 TMEM97Q5BJF2 176 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 IZUMO2Q6UXV1 221 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 TEX29Q8N6K0 151 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 OTUD6BQ8N6M0 293 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 FAM216BQ8N7L0 139 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 C5orf17Q8NAS9 161 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 OR8J2Q8NGG1 315 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 OR10X1Q8NGY0 326 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 DIRC1Q969H9 104 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 BORCS7Q96B45 105 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 ISOC1Q96CN7 298 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 BORCS8Q96FH0 119 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 TEX37Q96LM6 180 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 YPEL2Q96QA6 119 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 OR4C12Q96R67 309 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 DSCR8Q96T75 97 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 SIGMAR1Q99720 223 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 OR2H1Q9GZK4 316 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 OR2J1Q9GZK6 312 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 BPESC1Q9GZL8 116 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 IMUPQ9GZP8 106 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 PARVBQ9HBI1 364 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 ENY2Q9NPA8 101 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 BIN3Q9NQY0 253 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 PRO0255Q9UI72 69 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 HERC1Q15751 4861 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 PLB1Q6P1J6 1458 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 ESPL1Q14674 2120 aa-0.29□□□□□ -2.46
CDH1-211ENST00000567320 NCOR1O75376 2440 aa-0.29□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms