RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556333.1

RCCD1-205, Transcript of RCC1 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RCCD1, Length 735 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1-205ENST00000556333 C1orf158Q8N1D5 194 aa14.63□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 MUC7Q8TAX7 377 aa14.63□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 VGLL1Q99990 258 aa14.63□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa14.63□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 DIRC3C9JPN6 131 aa14.62□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 UBE2G2P60604 165 aa14.62□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa14.62□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 Q8NAQ8 132 aa14.62□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 SUN5Q8TC36 379 aa14.62□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 A0A1B0GV50 99 aa14.61□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 RBAKDNA6NC62 111 aa14.61□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 GNG5P63218 68 aa14.61□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.61□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 SFT2D1Q8WV19 159 aa14.61□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 ODF3Q96PU9 254 aa14.61□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 SMIM9A6NGZ8 99 aa14.6□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 HBE1P02100 147 aa14.6□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 KIR3DS1Q14943 382 aa14.6□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa14.6□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 IL17DQ8TAD2 202 aa14.6□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 LINC01587Q99440 93 aa14.6□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 NEU1Q99519 415 aa14.6□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 H2AFB1P0C5Y9 115 aa14.59□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 RBMY1CP0DJD4 496 aa14.59□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 HTN1P15515 57 aa14.59□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 ZNF138P52744 262 aa14.59□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 RRN3P1Q2M238 152 aa14.59□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 C5orf17Q8NAS9 161 aa14.59□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 Q8TAT8 98 aa14.59□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 ZNF492Q9P255 531 aa14.59□□□□□ -0.07
RCCD1-205ENST00000556333 A0A1W2PRE2 83 aa14.58□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 GPX1P07203 203 aa14.58□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.58□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 ZFAND6Q6FIF0 208 aa14.58□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 TMEM256Q8N2U0 113 aa14.58□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa14.57□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 GGTLC3B5MD39 225 aa14.57□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 K7EQM0 130 aa14.57□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 IFNA7P01567 189 aa14.57□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 RAB5CP51148 216 aa14.57□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 EMP1P54849 157 aa14.57□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa14.57□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 MBD3L1Q8WWY6 194 aa14.57□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 C20orf144Q9BQM9 153 aa14.57□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa14.56□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 C3orf84H3BNL1 204 aa14.56□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 SULT1A2P50226 295 aa14.56□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 PMS2P11Q13670 270 aa14.56□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 C11orf45Q8TAV5 145 aa14.56□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa14.56□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 EPDR1Q9UM22 224 aa14.56□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 C7orf71A4D174 169 aa14.55□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 FAM74A7A6NL05 159 aa14.55□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 TCRAP04437 139 aa14.55□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 PRM2P04554 102 aa14.55□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 BTN1A1Q13410 526 aa14.55□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 CST9LP1Q5W188 147 aa14.55□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 FAM19A4Q96LR4 140 aa14.55□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 SGK494Q96LW2 274 aa14.55□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa14.54□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa14.54□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 TMEM189A5PLL7 270 aa14.54□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 CXorf65A6NEN9 183 aa14.54□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 H7BYZ3 331 aa14.54□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 CRISP2P16562 243 aa14.54□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.54□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 KLLNB2CW77 178 aa14.53□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 TEX46H3BTG2 121 aa14.53□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 TAS2R60P59551 318 aa14.53□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 ALKAL2Q6UX46 152 aa14.53□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 STAB2Q8WWQ8 2551 aa14.53□□□□□ -0.08
RCCD1-205ENST00000556333 PAGE4O60829 102 aa14.52□□□□□ -0.09
RCCD1-205ENST00000556333 NMBP08949 121 aa14.52□□□□□ -0.09
RCCD1-205ENST00000556333 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa14.52□□□□□ -0.09
RCCD1-205ENST00000556333 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa14.52□□□□□ -0.09
RCCD1-205ENST00000556333 ATG101Q9BSB4 218 aa14.52□□□□□ -0.09
RCCD1-205ENST00000556333 NDFIP1Q9BT67 221 aa14.52□□□□□ -0.09
RCCD1-205ENST00000556333 LENEPQ9Y5L5 61 aa14.52□□□□□ -0.09
RCCD1-205ENST00000556333 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa14.51□□□□□ -0.09
RCCD1-205ENST00000556333 AZU1P20160 251 aa14.51□□□□□ -0.09
RCCD1-205ENST00000556333 PPT1P50897 306 aa14.51□□□□□ -0.09
RCCD1-205ENST00000556333 CASC10Q5T4H9 136 aa14.51□□□□□ -0.09
RCCD1-205ENST00000556333 PRR9Q5T870 116 aa14.51□□□□□ -0.09
RCCD1-205ENST00000556333 CCDC28AQ8IWP9 274 aa14.51□□□□□ -0.09
RCCD1-205ENST00000556333 CELA1Q9UNI1 258 aa14.51□□□□□ -0.09
RCCD1-205ENST00000556333 ATP5G3P48201 142 aa14.5□□□□□ -0.09
RCCD1-205ENST00000556333 PRNTQ86SH4 94 aa14.5□□□□□ -0.09
RCCD1-205ENST00000556333 PYGO2Q9BRQ0 406 aa14.5□□□□□ -0.09
RCCD1-205ENST00000556333 TREM1Q9NP99 234 aa14.5□□□□□ -0.09
RCCD1-205ENST00000556333 PSG8Q9UQ74 426 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 289.1 ms