RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM256Q8N2U0 113 aa13.8□□□□□ -0.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BLNKQ8WV28 456 aa13.8□□□□□ -0.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FXYD5Q96DB9 178 aa13.8□□□□□ -0.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARPC5LQ9BPX5 153 aa13.8□□□□□ -0.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PAXXQ9BUH6 204 aa13.8□□□□□ -0.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR51M1Q9H341 326 aa13.8□□□□□ -0.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR7C2O60412 319 aa13.79□□□□□ -0.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KHDC3LQ587J8 217 aa13.79□□□□□ -0.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa13.79□□□□□ -0.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa13.78□□□□□ -0.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NBEAP1P0C6P0 100 aa13.78□□□□□ -0.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDKN1BP46527 198 aa13.78□□□□□ -0.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNF212Q495C1 297 aa13.78□□□□□ -0.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AKAP14Q86UN6 197 aa13.78□□□□□ -0.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR10G4Q8NGN3 311 aa13.78□□□□□ -0.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR10G9Q8NGN4 311 aa13.78□□□□□ -0.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR10G7Q8NGN6 311 aa13.78□□□□□ -0.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa13.78□□□□□ -0.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A1W2PPV4 95 aa13.77□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BCL2L11O43521 198 aa13.77□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MBP02144 154 aa13.77□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LEPP41159 167 aa13.77□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CD300CQ08708 224 aa13.77□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q6ZR54 194 aa13.77□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMUB2Q71RG4 321 aa13.77□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BAP18Q8IXM2 172 aa13.77□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C1orf158Q8N1D5 194 aa13.77□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNF141Q8WVD5 230 aa13.77□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa13.76□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP13.76□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STAG3L2P0CL84 134 aa13.76□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STAG3L3P0CL85 134 aa13.76□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SOHLH1Q5JUK2 328 aa13.76□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ODF3Q96PU9 254 aa13.76□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC01587Q99440 93 aa13.76□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C20orf144Q9BQM9 153 aa13.76□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa13.75□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR10J4P0C629 311 aa13.75□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HTN3P15516 51 aa13.75□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CSN1S1P47710 185 aa13.75□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM122CQ6P4D5 195 aa13.75□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PQLC2Q6ZP29 291 aa13.75□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB24Q969Q5 203 aa13.75□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HYLS1Q96M11 299 aa13.75□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa13.74□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRAC2D3DTV9 90 aa13.74□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NPIPB6E9PJ23 425 aa13.74□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ICAM4Q14773 271 aa13.74□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SUN5Q8TC36 379 aa13.74□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CRXO43186 299 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TAS2R60P59551 318 aa13.73□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF726P1Q15940 193 aa13.73□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SSX7Q7RTT5 188 aa13.73□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LYPD1Q8N2G4 141 aa13.73□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PHYHIPLQ96FC7 376 aa13.73□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC00477Q96M19 166 aa13.73□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 H7BYZ3 331 aa13.72□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 M0R3E3 92 aa13.72□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SEC11BP0C7V7 166 aa13.72□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DAD1P61803 113 aa13.72□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM74A1Q5RGS3 127 aa13.72□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM78Q5T7P6 136 aa13.72□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM88Q6PEY1 159 aa13.72□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa13.72□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STOML3Q8TAV4 291 aa13.72□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABCA13Q86UQ4 5058 aa13.72□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARL14EPLP0DKL9 152 aa13.71□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC28AQ8IWP9 274 aa13.71□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HTN1P15515 57 aa13.7□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RANP62826 216 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C1orf134Q5TEV5 83 aa13.7□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF493Q6ZR52 646 aa13.7□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C15orf53Q8NAA6 179 aa13.7□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C16orf74Q96GX8 76 aa13.7□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MUC4Q99102 2169 aa13.7□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa13.69□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LYRM9A8MSI8 78 aa13.69□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PFDN1O60925 122 aa13.69□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CT45A10P0DMU9 189 aa13.69□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C9orf62Q8N4C0 152 aa13.69□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CMTM2Q8TAZ6 248 aa13.69□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RXFP4Q8TDU9 374 aa13.69□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 J3KRW8 73 aa13.68□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TPT1P13693 172 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GCHFRP30047 84 aa13.68□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa13.68□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GFI1BQ5VTD9 330 aa13.68□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms