RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 LYPD1Q8N2G4 141 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 RARRES2Q99969 163 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 PRELID1Q9Y255 219 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 A8MTW9 85 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 ATP6V1G1O75348 118 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 RAB14P61106 215 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 OR11H2Q8NH07 326 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 FAM213BQ8TBF2 198 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 CSTL1Q9H114 145 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 AAMDCQ9H7C9 122 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 LINC00862A6NCI5 91 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 M0R3E3 92 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 UBE2CO00762 179 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 SULT1A2P50226 295 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 RAB5CP51148 216 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 RANP62826 216 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 ICAM4Q14773 271 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 ALKAL2Q6UX46 152 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 OR8A1Q8NGG7 326 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 Q9H3A6 140 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 TMEM167BQ9NRX6 74 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 PRAC2D3DTV9 90 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 IGKV3-20P01619 116 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 CNN1P51911 297 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 AMTNQ6UX39 209 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 Q6ZTC4 211 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 OR4B1Q8NGF8 309 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 SFT2D1Q8WV19 159 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 SCRT2Q9NQ03 307 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 UBR4Q5T4S7 5183 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 PGPA6NDG6 321 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 CA1P00915 261 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 NMBP08949 121 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 IQCF2Q8IXL9 164 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 OR10J6PQ8NGY7 276 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 OTORQ9NRC9 128 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 MED9Q9NWA0 146 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 C16orf90A8MZG2 172 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 NPIPB6E9PJ23 425 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 CSN1S1P47710 185 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 FAM74A1Q5RGS3 127 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 Q8N1X5 172 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 SLC35B3Q9H1N7 401 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-231ENST00000552222 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 A0A1W2PRE2 83 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 GGTLC3B5MD39 225 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 RBAKDNA6NC62 111 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 FAM74A7A6NL05 159 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 DIRC3C9JPN6 131 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 S100A1P23297 94 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 TCTAP57738 103 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 ERCC8Q13216 396 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 CMTM2Q8TAZ6 248 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 LINC00477Q96M19 166 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 XCL2Q9UBD3 114 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 A0A1B0GV50 99 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 CDK2AP2O75956 126 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 AMBPP02760 352 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 CT45A10P0DMU9 189 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 FXYD7P58549 80 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 UBE2G2P60604 165 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-231ENST00000552222 TNP2Q05952 138 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms