RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547715.1

PTPRB-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-205ENST00000547715 FOXI2Q6ZQN5 318 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRB-205ENST00000547715 LINC00588Q9Y4M8 146 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRB-205ENST00000547715 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRB-205ENST00000547715 RBFOX3A6NFN3 312 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRB-205ENST00000547715 IFITM10A6NMD0 228 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRB-205ENST00000547715 F5H768 121 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRB-205ENST00000547715 IGKV1-5P01602 117 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRB-205ENST00000547715 OR10J1P30954 320 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRB-205ENST00000547715 ERVFC1-1P60608 527 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRB-205ENST00000547715 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PTPRB-205ENST00000547715 RAB32Q13637 225 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRB-205ENST00000547715 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF506Q5JVG8 444 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRB-205ENST00000547715 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRB-205ENST00000547715 LHFPL1Q86WI0 220 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM208Q9BTX3 173 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRB-205ENST00000547715 SLC25A31Q9H0C2 315 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRB-205ENST00000547715 MAGT1Q9H0U3 335 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRB-205ENST00000547715 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 C9JQL5 133 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 H3BQ15 152 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 DEFB130BP0DP73 79 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 DEFB130AP0DP74 79 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 PSG9Q00887 426 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 LRTM2Q8N967 370 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 ISOC2Q96AB3 205 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM18Q96B42 140 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 CLUHP3Q96NS8 147 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 F6UB75 175 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 DLEU1O43261 78 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 ID1P41134 155 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 S100A10P60903 97 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM241Q24JQ0 296 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 BSXQ3C1V8 233 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 FAM78BQ5VT40 261 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 SSX7Q7RTT5 188 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 MARCH1Q8TCQ1 289 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 IMMP2LQ96T52 175 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 HIST1H2BLQ99880 126 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 Q9H8V8 135 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 FAT1Q14517 4588 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 LYRM9A8MSI8 78 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 AGPAT2O15120 278 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 PRM2P04554 102 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 P0C879 139 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 RD3LP0DJH9 198 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 FABP4P15090 132 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 PCP4P48539 62 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 PSMB3P49720 205 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 EBLN2Q6P2I7 272 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 IFNA1P01562 189 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 SRP19P09132 144 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 TRGC1P0CF51 173 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 UCP3P55916 312 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 BAXQ07812 192 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 TTC32Q5I0X7 151 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 Q5VSD8 79 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 LYPD1Q8N2G4 141 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 OR51G1Q8NGK1 321 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 TP53RKQ96S44 253 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 PHOX2AO14813 284 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 TOMM40O96008 361 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 ATP5G1P05496 136 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 GZMBP10144 247 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 PSG1P11464 419 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 ATP5G3P48201 142 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 PAX9P55771 341 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 C1orf194Q5T5A4 169 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 NPIPB3Q92617 1050 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 FRZBQ92765 325 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 PYGO2Q9BRQ0 406 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 A0A0G2JRQ6 117 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 A0A0J9YX75 114 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 PITX3O75364 302 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 PI3P19957 117 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 AKR1C3P42330 323 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 C2orf83Q53S99 150 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 GPR146Q96CH1 333 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 RNF125Q96EQ8 232 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 Q9H3A6 140 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 GSKIPQ9P0R6 139 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRB-205ENST00000547715 A0A1W2PPQ1 181 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 SOCS3O14543 225 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 NXPH3O95157 252 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 CDS2O95674 445 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 TRGC2P03986 189 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 PIGPP57054 158 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 ETFRF1Q6IPR1 90 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 LGI3Q8N145 548 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 OR2D3Q8NGH3 330 aa10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.8 ms