RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 OR10G4Q8NGN3 311 aa4.03□□□□□ -1.76
CLSTN3-215ENST00000544584 OR10G9Q8NGN4 311 aa4.03□□□□□ -1.76
CLSTN3-215ENST00000544584 OR10G7Q8NGN6 311 aa4.03□□□□□ -1.76
CLSTN3-215ENST00000544584 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
CLSTN3-215ENST00000544584 AQP10Q96PS8 301 aa4.03□□□□□ -1.76
CLSTN3-215ENST00000544584 ATG101Q9BSB4 218 aa4.03□□□□□ -1.76
CLSTN3-215ENST00000544584 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM167BQ9NRX6 74 aa4.03□□□□□ -1.76
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF586Q9NXT0 402 aa4.03□□□□□ -1.76
CLSTN3-215ENST00000544584 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa4.03□□□□□ -1.76
CLSTN3-215ENST00000544584 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
CLSTN3-215ENST00000544584 LENEPQ9Y5L5 61 aa4.03□□□□□ -1.76
CLSTN3-215ENST00000544584 DNAH10Q8IVF4 4471 aa4.03□□□□□ -1.76
CLSTN3-215ENST00000544584 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 TRGV2A0A075B6R0 118 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAV5A0A0B4J249 113 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 C7orf71A4D174 169 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 NPIPB6E9PJ23 425 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 H0YIZ8 118 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 H3BQ15 152 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 CXorf1O96002 111 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 OR10J4P0C629 311 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 DEFB130BP0DP73 79 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 DEFB130AP0DP74 79 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF138P52744 262 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 CCL18P55774 89 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 RANP62826 216 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF212Q495C1 297 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 ZFP69Q49AA0 526 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 DMRTA1Q5VZB9 504 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM122CQ6P4D5 195 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 OR2T35Q8NGX2 323 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 OR2G3Q8NGZ4 309 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 STOML3Q8TAV4 291 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 TMED6Q8WW62 240 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 C17orf77Q96MU5 243 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC25A2Q9BXI2 301 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 SMIM3Q9BZL3 60 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 OTORQ9NRC9 128 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 TNFSF18Q9UNG2 199 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 KMT2AQ03164 3969 aa4.02□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.01□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 F5H768 121 aa4.01□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 F6UZH7 168 aa4.01□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 H3BTX0 84 aa4.01□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC17A3O00476 420 aa4.01□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 CRXO43186 299 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
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CLSTN3-215ENST00000544584 PYYP10082 97 aa4.01□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 CRISP2P16562 243 aa4.01□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 PPT1P50897 306 aa4.01□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 DEFB1P60022 68 aa4.01□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 FCN2Q15485 313 aa4.01□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.01□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM159AQ6UWV7 190 aa4.01□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 MIR17HGQ75NE6 70 aa4.01□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNS1Q96KK3 526 aa4.01□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.01□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 SH3BGRL3Q9H299 93 aa4.01□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 Q9H3A6 140 aa4.01□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 APLNQ9ULZ1 77 aa4.01□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 PKHD1P08F94 4074 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAV21A0A0B4J279 112 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A0D9SG52 128 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 PGPA6NDG6 321 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 KLLNB2CW77 178 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 TEX46H3BTG2 121 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 J3KRW8 73 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 NDUFB4O95168 129 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 CT45A10P0DMU9 189 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF415Q09FC8 603 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 OR5I1Q13606 314 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 LGALS9BQ3B8N2 356 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 GCSAMLQ5JQS6 135 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 GFI1BQ5VTD9 330 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 MORN5Q5VZ52 161 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 IQCF2Q8IXL9 164 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 FXYD5Q96DB9 178 aa4□□□□□ -1.77
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