RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538258.1

PGA3-204, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PGA3, Length 867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-204ENST00000538258 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.72□□□□□ -1.33
PGA3-204ENST00000538258 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.71□□□□□ -1.33
PGA3-204ENST00000538258 TENM3Q9P273 2699 aa6.71□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 EREGO14944 169 aa6.71□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 COX7A2P2O60397 106 aa6.71□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 PCP4P48539 62 aa6.71□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 FHITP49789 147 aa6.71□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 APOC4P55056 127 aa6.71□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 PSMG4Q5JS54 123 aa6.71□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.71□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 MIC13Q5XKP0 118 aa6.71□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 PATE2Q6UY27 113 aa6.71□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.71□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.71□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 GPR82Q96P67 336 aa6.71□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 UHRF2Q96PU4 802 aa6.71□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.71□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 RSG1Q9BU20 258 aa6.71□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.71□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 RETNQ9HD89 108 aa6.71□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 KNCNA6PVL3 124 aa6.7□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 MPDU1O75352 247 aa6.7□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 IFNA1P01562 189 aa6.7□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 BCL2P10415 239 aa6.7□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 ID1P41134 155 aa6.7□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 PRR20EP86478 221 aa6.7□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 PRR20CP86479 221 aa6.7□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 PRR20DP86480 221 aa6.7□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 PRR20BP86481 221 aa6.7□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 PRR20AP86496 221 aa6.7□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.7□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 STHQ8IWL8 128 aa6.7□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.7□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 ATP5SQ99766 215 aa6.7□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.7□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 NAT8Q9UHE5 227 aa6.7□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 RNF24Q9Y225 148 aa6.7□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 XKRY2A2RUG3 117 aa6.69□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 PSMB3P49720 205 aa6.69□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.69□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.69□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.69□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 ZNF709Q8N972 641 aa6.69□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.69□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.69□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 C16orf92Q96LL3 132 aa6.69□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.69□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.69□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.69□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.69□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.69□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.69□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 TMEM250H0YL14 139 aa6.68□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 ISLRO14498 428 aa6.68□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 SOCS3O14543 225 aa6.68□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 IFNA5P01569 189 aa6.68□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 SERF2P84101 59 aa6.68□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 COTL1Q14019 142 aa6.68□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 DEFB135Q30KP9 77 aa6.68□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.68□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.68□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 Q6ZWC4 215 aa6.68□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.68□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 CSTL1Q9H114 145 aa6.68□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.68□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 A0A1W2PPQ1 181 aa6.67□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.67□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 SPRY2O43597 315 aa6.67□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 ESDP10768 282 aa6.67□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 MORN5Q5VZ52 161 aa6.67□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.67□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.67□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 C17orf77Q96MU5 243 aa6.67□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.67□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 NAGKQ9UJ70 344 aa6.67□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.67□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.66□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 A0A087X0K7 114 aa6.66□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.66□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.66□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 K7EP13 123 aa6.66□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 HLA-DRB4P13762 266 aa6.66□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 G0S2P27469 103 aa6.66□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 DEFB1P60022 68 aa6.66□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.66□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.66□□□□□ -1.34
PGA3-204ENST00000538258 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.66□□□□□ -1.34
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