RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533677.1

PAFAH1B2-208, Transcript of platelet activating factor acetylhydrolase 1b catalytic subunit 2, human

TSL 3

Gene PAFAH1B2, Length 756 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SLC35E1	Q96K37	410 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SMIM8	Q96KF7	97 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	VSIR	Q9H7M9	311 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RETN	Q9HD89	108 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SMPX	Q9UHP9	88 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SMCO3	A2RU48	225 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	ZFP92	A6NM28	416 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SSNA1	O43805	119 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	DEDD	O75618	318 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	CRYBB3	P26998	211 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	CAV2	P51636	162 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	LYZ	P61626	148 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RAB11A	P62491	216 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	AKR1C1	Q04828	323 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	LCN12	Q6JVE5	192 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	MGST2	Q99735	147 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RNF126	Q9BV68	326 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	DOK5	Q9P104	306 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RFNG	Q9Y644	331 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SMLR1	H3BR10	107 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677		K7EMT4	169 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	MPC2	O95563	127 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	P2RY1	P47900	373 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	BCAP31	P51572	246 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RGS21	Q2M5E4	152 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TCF24	Q7RTU0	167 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TRGV9	Q99603	122 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	NMES1	Q9C002	83 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PALMD	Q9NP74	551 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677		L7N2F9	121 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RD3L	P0DJH9	198 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TAS2R30	P59541	319 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PATE2	Q6UY27	113 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	DCANP1	Q8TF63	244 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	MARC2	Q969Z3	335 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	B9D2	Q9BPU9	175 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	GINS3	Q9BRX5	216 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	WFDC1	Q9HC57	220 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	OR11H12	B2RN74	326 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677		H3BRN7	92 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	AGPAT2	O15120	278 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	ZNF688	P0C7X2	276 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	LINC00869	P0C866	280 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	ORM2	P19652	201 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SULT1A1	P50225	295 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	CLINT1	Q14677	625 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	MIC13	Q5XKP0	118 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677		Q8WTZ3	238 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	METTL26	Q96S19	204 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SPX	Q9BT56	116 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RABAC1	Q9UI14	185 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	KMT2A	Q03164	3969 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RNF222	A6NCQ9	220 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	KNCN	A6PVL3	124 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677		H3BTX0	84 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	NPPC	P23582	126 aa		5.04	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms