RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523263.1

VIRMA-208, Transcript of vir like m6A methyltransferase associated, human

TSL 3

Gene VIRMA, Length 609 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VIRMA-208	ENST00000523263	SFT2D2	O95562	160 aa		6.29	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	OR4E1	P0C645	316 aa		6.29	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	CD300C	Q08708	224 aa		6.29	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	ASAH1	Q13510	395 aa		6.29	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	IL18	Q14116	193 aa		6.29	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	OPCML	Q14982	345 aa		6.29	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		6.29	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		6.29	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		6.29	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	MCUB	Q9NWR8	336 aa		6.29	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	PRELID1	Q9Y255	219 aa		6.29	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263		E5RGE8	158 aa		6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	AGPAT2	O15120	278 aa		6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	COX7A2P2	O60397	106 aa		6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	GYPE	P15421	78 aa		6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	TAS2R30	P59541	319 aa		6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	BTN1A1	Q13410	526 aa		6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	MORN5	Q5VZ52	161 aa		6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	RASL10A	Q92737	203 aa		6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	SOST	Q9BQB4	213 aa		6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		6.28	□□□□□ -1.4
VIRMA-208	ENST00000523263	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		6.27	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263		C9JCJ5	164 aa		6.27	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263		H3BTX0	84 aa		6.27	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	RGS13	O14921	159 aa		6.27	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	GPX1	P07203	203 aa		6.27	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	HOXB5	P09067	269 aa		6.27	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	VAMP1	P23763	118 aa		6.27	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	PDE6H	Q13956	83 aa		6.27	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	LAGE3	Q14657	143 aa		6.27	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		6.27	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		6.27	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	SPX	Q9BT56	116 aa		6.27	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	TM2D2	Q9BX73	214 aa		6.27	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		6.26	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263		A6NJY4	79 aa		6.26	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	TSC22D2	O75157	780 aa		6.26	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	CCNK	O75909	580 aa		6.26	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	ERCC8	Q13216	396 aa		6.26	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	PPP1R1A	Q13522	171 aa		6.26	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263		Q6ZRG5	221 aa		6.26	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		6.26	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	BLNK	Q8WV28	456 aa		6.26	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	ZNF479	Q96JC4	524 aa		6.26	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	SRR	Q9GZT4	340 aa		6.26	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		6.26	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		6.25	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263		M0R3E3	92 aa		6.25	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		6.25	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	AP3S2	P59780	193 aa		6.25	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	RAB31	Q13636	194 aa		6.25	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	SCX	Q7RTU7	201 aa		6.25	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	PFDN5	Q99471	154 aa		6.25	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	MGST2	Q99735	147 aa		6.25	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		6.25	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		6.25	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	ZNF492	Q9P255	531 aa		6.25	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		6.24	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		6.24	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	SSSCA1	O60232	199 aa		6.24	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	NDUFB4	O95168	129 aa		6.24	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	SFTA3	P0C7M3	94 aa		6.24	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	TNFSF8	P32971	234 aa		6.24	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	CAMLG	P49069	296 aa		6.24	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	ARL16	Q0P5N6	197 aa		6.24	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		6.24	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	PRR9	Q5T870	116 aa		6.24	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		6.24	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		6.24	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	IGLV2-8	P01709	118 aa		6.23	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	ZNF846	Q147U1	533 aa		6.23	□□□□□ -1.41
VIRMA-208	ENST00000523263	TRIM63	Q969Q1	353 aa		6.23	□□□□□ -1.41

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