RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 RPL29P47914 159 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
ITGA3-215ENST00000515147 BTN1A1Q13410 526 aa12.34□□□□□ -0.43
ITGA3-215ENST00000515147 VWC2Q2TAL6 325 aa12.34□□□□□ -0.43
ITGA3-215ENST00000515147 CNPY1Q3B7I2 92 aa12.34□□□□□ -0.43
ITGA3-215ENST00000515147 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa12.34□□□□□ -0.43
ITGA3-215ENST00000515147 LYPD1Q8N2G4 141 aa12.34□□□□□ -0.43
ITGA3-215ENST00000515147 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
ITGA3-215ENST00000515147 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa12.34□□□□□ -0.43
ITGA3-215ENST00000515147 FAM25EA8MYX2 175 aa12.33□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 IL7P13232 177 aa12.33□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 LINC00477Q96M19 166 aa12.33□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 C20orf85Q9H1P6 137 aa12.33□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa12.32□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 SPINK4O60575 86 aa12.32□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 TCL1AP56279 114 aa12.32□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 TMEM14CQ9P0S9 112 aa12.32□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 MYCBP2O75592 4640 aa12.32□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 A6NHS1 94 aa12.31□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 PAX4O43316 350 aa12.31□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 MPDU1O75352 247 aa12.31□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 NXPH4O95158 308 aa12.31□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 GPX1P07203 203 aa12.31□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 PYYP10082 97 aa12.31□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 CRISP2P16562 243 aa12.31□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 BAXQ07812 192 aa12.31□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa12.31□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 CHAC2Q8WUX2 184 aa12.31□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa12.31□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa12.31□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 PRELID1Q9Y255 219 aa12.31□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 TIMM9Q9Y5J7 89 aa12.31□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa12.31□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 ICOSQ9Y6W8 199 aa12.31□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 C5orf51A6NDU8 294 aa12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 PLA2G10O15496 165 aa12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 IGHV3-53P01767 116 aa12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 S100A11P31949 105 aa12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 SULT1A1P50225 295 aa12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 PDE6HQ13956 83 aa12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 Q5VSD8 79 aa12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 Q6ZQT7 251 aa12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 BLNKQ8WV28 456 aa12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 ST6GAL2Q96JF0 529 aa12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 C2orf50Q96LR7 162 aa12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 IGSF23A1L1A6 192 aa12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 NMBP08949 121 aa12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 PRR9Q5T870 116 aa12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 TMEM252Q8N6L7 170 aa12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 SEC22CQ9BRL7 303 aa12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 PRO0255Q9UI72 69 aa12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 TRAV6A0A075B6T7 132 aa12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 RGS13O14921 159 aa12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 EREGO14944 169 aa12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 TCRBP04435 133 aa12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 FGF7P21781 194 aa12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 ERVFC1-1P60608 527 aa12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 ICAM4Q14773 271 aa12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 GCSAMLQ5JQS6 135 aa12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 VGLL1Q99990 258 aa12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 AAMDCQ9H7C9 122 aa12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-215ENST00000515147 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 LYRM1O43325 122 aa12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 CRYBA4P53673 196 aa12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 S100A10P60903 97 aa12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 HBG1P69891 147 aa12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 HBG2P69892 147 aa12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 IL15RAQ13261 267 aa12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 TMEM78Q5T7P6 136 aa12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 FAM122CQ6P4D5 195 aa12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 LYPD5Q6UWN5 251 aa12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 STX12Q86Y82 276 aa12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 SLC25A2Q9BXI2 301 aa12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 PTTG2Q9NZH5 202 aa12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 HHLA3Q9XRX5 114 aa12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 PRAF2O60831 178 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 SLAQ13239 276 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 RAB32Q13637 225 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 FHL2Q14192 279 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 ATP6V1FQ16864 119 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 CDPF1Q6NVV7 123 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 C8orf49Q96NF6 230 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 NPCDR1Q9BY65 106 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 NUDT15Q9NV35 164 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF492Q9P255 531 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 DNAH10OSP0CZ25 163 aa12.25□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 KRTAP10-1P60331 282 aa12.25□□□□□ -0.45
ITGA3-215ENST00000515147 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms