RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514596.1

CTBP1-215, Transcript of C-terminal binding protein 1, human

TSL 2

Gene CTBP1, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP1-215	ENST00000514596	STOML3	Q8TAV4	291 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	SUN5	Q8TC36	379 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	LINC00477	Q96M19	166 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	RBAKDN	A6NC62	111 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	UMAD1	C9J7I0	102 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	ZNF726P1	Q15940	193 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	SSX7	Q7RTT5	188 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	KMT2A	Q03164	3969 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596		A0A1B0GVG6	124 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	TMEM189	A5PLL7	270 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	HBE1	P02100	147 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	CT45A10	P0DMU9	189 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	ERCC8	Q13216	396 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	ZFP69	Q49AA0	526 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	PGP	A6NDG6	321 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	DIRC3	C9JPN6	131 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	DEFB4A	O15263	64 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	CD300C	Q08708	224 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	RRN3P1	Q2M238	152 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	VGLL1	Q99990	258 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	ZNF492	Q9P255	531 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTBP1-215	ENST00000514596	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596		A0A1W2PRE2	83 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	NMB	P08949	121 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	CRISP2	P16562	243 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	ZNF138	P52744	262 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	SLC51B	Q86UW2	128 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	TMED6	Q8WW62	240 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	KLLN	B2CW77	178 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596		H7BYZ3	331 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	TAS2R60	P59551	318 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	C7orf71	A4D174	169 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	GGTLC3	B5MD39	225 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	FHIT	P49789	147 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	KIR3DS1	Q14943	382 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	LINC01587	Q99440	93 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596		J3KRW8	73 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	RAB5C	P51148	216 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596		Q8TAT8	98 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596		K7EQM0	130 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	GPX1	P07203	203 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	GNG5	P63218	68 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	TCRA	P04437	139 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	C16orf74	Q96GX8	76 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	CELA1	Q9UNI1	258 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP1-215	ENST00000514596	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26

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