RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 UQCC1Q9NVA1 299 aa11.25□□□□□ -0.61
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ITGA3-211ENST00000508100 S100A10P60903 97 aa11.19□□□□□ -0.62
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ITGA3-211ENST00000508100 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa11.19□□□□□ -0.62
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ITGA3-211ENST00000508100 RGS21Q2M5E4 152 aa11.18□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 CHAC2Q8WUX2 184 aa11.18□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa11.18□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 INAFM2P0DMQ5 153 aa11.17□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.17□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 CRYBA4P53673 196 aa11.17□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 ATP6V1FQ16864 119 aa11.17□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 FAM122CQ6P4D5 195 aa11.17□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 LYPD5Q6UWN5 251 aa11.17□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 NEGR1Q7Z3B1 354 aa11.17□□□□□ -0.62
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM252Q8N6L7 170 aa11.17□□□□□ -0.62
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ITGA3-211ENST00000508100 C11orf1Q9H5F2 150 aa11.17□□□□□ -0.62
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