RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 C8orf49Q96NF6 230 aa8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 PRR25Q96S07 402 aa8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 ASCL2Q99929 193 aa8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 VGLL1Q99990 258 aa8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 VPREB3Q9UKI3 123 aa8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 HIVEP2P31629 2446 aa8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 JMJD1CQ15652 2540 aa8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 FBN3Q75N90 2809 aa8.24□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.24□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.24□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.24□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 GRIFINA4D1Z8 144 aa8.24□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 A8MWP6 167 aa8.24□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV3-11P01762 117 aa8.24□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 APCSP02743 223 aa8.24□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.24□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM209BQ5JX69 171 aa8.24□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 GATD1Q8NB37 220 aa8.24□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 NIT2Q9NQR4 276 aa8.24□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 K7EMT4 169 aa8.23□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 HAX1O00165 279 aa8.23□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 CD5LO43866 347 aa8.23□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 S100A12P80511 92 aa8.23□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 SLAQ13239 276 aa8.23□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.23□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.23□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.23□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.23□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 GPHB5Q86YW7 130 aa8.23□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.23□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM158Q8WZ71 300 aa8.23□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM18Q96B42 140 aa8.23□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.23□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa8.23□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF702PQ9H963 129 aa8.23□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.23□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 F2Z2F3 143 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 SOCS3O14543 225 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 SH2D1AO60880 128 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 GZMBP10144 247 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 RAB4BP61018 213 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 HBBP68871 147 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF575Q86XF7 245 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.21□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PS18 150 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 SERF1AO75920 110 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 CT45A10P0DMU9 189 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 SRIP30626 198 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 CAMPP49913 170 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 PAFAH1B2P68402 229 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 ERCC8Q13216 396 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 C10orf99Q6UWK7 81 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 Q8N2B8 174 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 RNF182Q8N6D2 247 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 RNF152Q8N8N0 203 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 Q8TAT8 98 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 SMPXQ9UHP9 88 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM189A5PLL7 270 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 ELANEP08246 267 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 BMI1P35226 326 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 RIGQ13278 110 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 FOXE3Q13461 319 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 Q6AWC8 147 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 BAGE3Q86Y29 109 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 C20orf173Q96LM9 149 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1B0GUT8 65 aa8.19□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1B0GW15 77 aa8.19□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF138P52744 262 aa8.19□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 TM4SF20Q53R12 229 aa8.19□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 IL17RELQ6ZVW7 336 aa8.19□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM86BQ8N661 226 aa8.19□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 TEX29Q8N6K0 151 aa8.19□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.18□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 GPX1P07203 203 aa8.18□□□□□ -1.1
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