RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	TNC	P24821	2201 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	MORN5	Q5VZ52	161 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574		Q6ZPA2	131 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	LINC00477	Q96M19	166 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	C2orf70	A6NJV1	201 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574		K7EM74	188 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	RRN3P1	Q2M238	152 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	DUX3	Q96PT4	197 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574		H3BRN7	92 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	UCN	P55089	124 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF876P	Q49A33	203 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	DTX2	Q86UW9	622 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	NUP37	Q8NFH4	326 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	NDUFB8	O95169	186 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	EFNA4	P52798	201 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	NPC2	P61916	151 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	RBX1	P62877	108 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	HLA-DRB4	P13762	266 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	NDP	Q00604	133 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	KLRD1	Q13241	179 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM101	Q96IK0	257 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574		U3KQA8	63 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PKD1-222	ENST00000496574	GTSF1	Q8WW33	167 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	OOSP1	A8MZH6	123 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	IGLL5	B9A064	214 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	PATE2	Q6UY27	113 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	LINC00311	Q8N616	119 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574		G3V4G9	280 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	CTRL	P40313	264 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	WFDC2	Q14508	124 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574		Q8TCH9	128 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574		A0A087WX48	190 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF688	P0C7X2	276 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	FXYD2	P54710	66 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	C17orf77	Q96MU5	243 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	SRD5A1	P18405	259 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574		H3BMM0	161 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	IGLV1-44	P01699	117 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574		P0C879	139 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	UBE2W	Q96B02	151 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	OBSL1	O75147	1896 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	PMVK	Q15126	192 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	FGF6	P10767	208 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	CD59	P13987	128 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	SLC25A20	O43772	301 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574		A0A087WWL8	130 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	IFITM1	P13164	125 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	GP9	P14770	177 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	SPX	Q9BT56	116 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	GAGE12J	A6NER3	117 aa		11.23	□□□□□ -0.61

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