RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495426.1

BBS9-213, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 9, human

TSL 3

Gene BBS9, Length 481 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS9-213	ENST00000495426	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426		H3BP45	60 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	VCY	O14598	125 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	PITX3	O75364	302 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	HYPM	O75409	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	IL5	P05113	134 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	AKAIN1	P0CW23	69 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	CXCL2	P19875	107 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	AP3S1	Q92572	193 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	PRRT1	Q99946	306 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	WRB	O00258	174 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	SLC17A3	O00476	420 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	PSCA	O43653	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	MED6	O75586	246 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	ANXA3	P12429	323 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	EVI2A	P22794	236 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	LEP	P41159	167 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	PLP1	P60201	277 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	ODF3	Q96PU9	254 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	C7orf71	A4D174	169 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426		H3BTX0	84 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426		K7EP13	123 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	SYNGR2	O43760	224 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	CAMP	P49913	170 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	TCL1A	P56279	114 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	S100A7A	Q86SG5	101 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	VGLL1	Q99990	258 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	ARL6	Q9H0F7	186 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	ARV1	Q9H2C2	271 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	LRP2	P98164	4655 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426		A0A087WXM4	84 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	SPINK4	O60575	86 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	CRYGD	P07320	174 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	PRSS2	P07478	247 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	SLC25A6	P12236	298 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	SRI	P30626	198 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	CRYBA4	P53673	196 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	SELENOT	P62341	195 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	BTN1A1	Q13410	526 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426		Q8N814	137 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	MCUB	Q9NWR8	336 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	RNF24	Q9Y225	148 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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