RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493618.5

ATG4B-223, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4B, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4B-223	ENST00000493618	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	IFITM3	Q01628	133 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	ICAM4	Q14773	271 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618		Q6ZTI0	123 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	SSX7	Q7RTT5	188 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618		E5RGE8	158 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	MED14OS	P0DP75	135 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	TNP2	Q05952	138 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	NMES1	Q9C002	83 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	PRELID1	Q9Y255	219 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	RYR1	P21817	5038 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	OR10J4	P0C629	311 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	M6PR	P20645	277 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	PRR9	Q5T870	116 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618		Q6ZQT7	251 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	C6orf223	Q8N319	242 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	LINC00477	Q96M19	166 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	VGLL1	Q99990	258 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	KLLN	B2CW77	178 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	GPX1	P07203	203 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	PDE6H	Q13956	83 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	OR51M1	Q9H341	326 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	H2BFS	P57053	126 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	ESRG	Q1W209	222 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	FXYD5	Q96DB9	178 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	PAXX	Q9BUH6	204 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618		Q9H8V8	135 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	MUC4	Q99102	2169 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	PRAF2	O60831	178 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	10.15	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618		Q8TAT8	98 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618	FUT9	Q9Y231	359 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ATG4B-223	ENST00000493618		A6NHS1	94 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	RGS13	O14921	159 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	OR7C2	O60412	319 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	CRISP2	P16562	243 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	ATP5S	Q99766	215 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF492	Q9P255	531 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	SSNA1	O43805	119 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	IGHV3-53	P01767	116 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF503	Q96F45	646 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	HSPB11	Q9Y547	144 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	HSPG2	P98160	4391 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618		A0A096LPF7	62 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	C16orf90	A8MZG2	172 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	SPINK4	O60575	86 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	MPC2	O95563	127 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF138	P52744	262 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	TCL1A	P56279	114 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	MUC21	Q5SSG8	566 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618		Q9H3A6	140 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618		H3BNG1	76 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ATG4B-223	ENST00000493618	MBD2	Q9UBB5	411 aa		10.11	□□□□□ -0.79

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