RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF253	O75346	499 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	SAP30	O75446	220 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	PYY	P10082	97 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	ORM2	P19652	201 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	NPPC	P23582	126 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	PPT1	P50897	306 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	LYZ	P61626	148 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	PDE6H	Q13956	83 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	GUK1	Q16774	197 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	LCN15	Q6UWW0	184 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717		Q8WTZ3	238 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	DOK5	Q9P104	306 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A1W2PPV4	95 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM218	A2RU14	115 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	TAS2R45	P59539	299 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	DEFA6	Q01524	100 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	GPR82	Q96P67	336 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	OR4F4	Q96R69	305 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	RARRES2	Q99969	163 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	RABAC1	Q9UI14	185 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A087WZ39	114 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	LINC01619	G3V211	115 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC17A3	O00476	420 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	TSHB	P01222	138 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	ZP3	P21754	424 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	ATP5G3	P48201	142 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	HAGH	Q16775	308 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	LINC00052	Q96N35	136 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	METTL26	Q96S19	204 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	SEC11C	Q9BY50	192 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	GNG13	Q9P2W3	67 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	RNF24	Q9Y225	148 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A1B0GV50	99 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717		A8MTW9	85 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	OR7C2	O60412	319 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	CIDEA	O60543	219 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	IFNA1	P01562	189 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	OR10J4	P0C629	311 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	MEOX2	P50222	304 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	RPEL1	Q2QD12	228 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	S100A7A	Q86SG5	101 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	STPG4	Q8N801	248 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	OR11H1	Q8NG94	326 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DCTN1-222	ENST00000492717	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		4.23	□□□□□ -1.73

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