RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 CLEC3BP05452 202 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 LYPD1Q8N2G4 141 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 NPFFO15130 113 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 LEPROTL1O95214 131 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 RHOGP84095 191 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 TPPP3Q9BW30 176 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 LINC00527Q9UJ94 153 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 K7EQM0 130 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 APOHP02749 345 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 ARMS2P0C7Q2 107 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 ZANQ9Y493 2812 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 BRD3OSQ6XYD6 125 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 AAMDCQ9H7C9 122 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 RABAC1Q9UI14 185 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 FAM162BQ5T6X4 162 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 Q8TAT8 98 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 ZNF502Q8TBZ5 544 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 CSTL1Q9H114 145 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 IGHG4P01861 327 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 PPBPP02775 128 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 CLEC19AQ6UXS0 136 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 RAB37Q96AX2 223 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 LRRK2Q5S007 2527 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 CSMD2Q7Z408 3487 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 VGLL1Q99990 258 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 RPL7P18124 248 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 PDE6HQ13956 83 aa9.96□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 TM4SF20Q53R12 229 aa9.96□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 FAM231BA6NCW3 169 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 HAX1O00165 279 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 NCR2O95944 276 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 CSN1S1P47710 185 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 DEFB125Q8N687 156 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 CCDC140Q96MF4 163 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 NDFIP1Q9BT67 221 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GUT8 65 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 S100A7AQ86SG5 101 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 C7orf71A4D174 169 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 TMEM238C9JI98 176 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 PRAC2D3DTV9 90 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 SH2D1AO60880 128 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 PRSS57Q6UWY2 283 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 RNF182Q8N6D2 247 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 C5orf56Q8N8D9 126 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 JMJD8Q96S16 334 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 ZNF462Q96JM2 2506 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 CT45A10P0DMU9 189 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 PAX8Q06710 450 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 ERCC8Q13216 396 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 PIFOQ8TCI5 191 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 TRAV40A0A0B4J280 105 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 CLPSL1A2RUU4 121 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 K7EMI3 77 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 CRXO43186 299 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 CLEC2AQ6UVW9 174 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 PRR25Q96S07 402 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 SCRT2Q9NQ03 307 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 TMEM213A2RRL7 107 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 H3BUT2 72 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 RIGQ13278 110 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 USP24Q9UPU5 2620 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 TMEM189A5PLL7 270 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 BUB3O43684 328 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 OR5AL1P0C617 328 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 LY6EQ16553 131 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 WFDC3Q8IUB2 231 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 CCL19Q99731 98 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 ST20Q9HBF5 79 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 IGHV1-69P01742 117 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PRAME-213ENST00000492657 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms