RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489630.5

VWA3B-217, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 2

Gene VWA3B, Length 2,575 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-217ENST00000489630 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 HLA-DMBP28068 263 aa8□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF575Q86XF7 245 aa8□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 DEFB124Q8NES8 71 aa8□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 VGLL1Q99990 258 aa8□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 CHAC1Q9BUX1 264 aa8□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 KAAG1Q9UBP8 84 aa8□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 TACC2O95359 2948 aa8□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 CSMD1Q96PZ7 3565 aa8□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 A0A0G2JNJ9 132 aa8□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 CEACAM4O75871 244 aa8□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 GFRALQ6UXV0 394 aa8□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 RNF185Q96GF1 192 aa8□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 PRR25Q96S07 402 aa8□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 Q9UFV3 132 aa8□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 HHLA3Q9XRX5 114 aa8□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa7.99□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 TIMM23O14925 209 aa7.99□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 GNG7O60262 68 aa7.99□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 PRSS1P07477 247 aa7.99□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 PPIAL4GP0DN37 164 aa7.99□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 PPIFP30405 207 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 ZGRF1Q86YA3 2104 aa7.99□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.99□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 DMXL1Q9Y485 3027 aa7.99□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.99□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.99□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.99□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 ORM1P02763 201 aa7.98□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 IGLC6P0CF74 106 aa7.98□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 PDE6HQ13956 83 aa7.98□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 FAM57AQ8TBR7 257 aa7.98□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 FOXC2Q99958 501 aa7.98□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 BDP1A6H8Y1 2624 aa7.98□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 CKS1BP61024 79 aa7.98□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.97□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.97□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 TNFRSF6BO95407 300 aa7.97□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 IGKCP01834 107 aa7.97□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.97□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 ZMAT4Q9H898 229 aa7.97□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 E7EQL1 145 aa7.97□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 F8W735 103 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 TSPAN13O95857 204 aa7.97□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 SMIM17P0DL12 118 aa7.97□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 FCER1GP30273 86 aa7.97□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 ERCC8Q13216 396 aa7.97□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 Q6ZS92 163 aa7.97□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM158Q8WZ71 300 aa7.97□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 POLEQ07864 2286 aa7.96□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.96□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM8BA6NDV4 472 aa7.96□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 LY6LH3BQJ8 138 aa7.96□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 IGHG4P01861 327 aa7.96□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.96□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.96□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 HIGD1BQ9P298 99 aa7.96□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.96□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.96□□□□□ -1.13
VWA3B-217ENST00000489630 CUL9Q8IWT3 2517 aa7.96□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 NBR2O15453 112 aa7.96□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 WFDC2Q14508 124 aa7.96□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.96□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.96□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.96□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.96□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM160Q9NX00 188 aa7.96□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 SHISA9B4DS77 424 aa7.95□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 AZU1P20160 251 aa7.95□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 MFAP4P55083 255 aa7.95□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 IGFL3Q6UXB1 125 aa7.95□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 CEND1Q8N111 149 aa7.95□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 MTURNQ8N3F0 131 aa7.95□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 PIFOQ8TCI5 191 aa7.95□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.95□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 PRAC2D3DTV9 90 aa7.95□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 DPM2O94777 84 aa7.95□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.95□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 DYNAPQ8N1N2 210 aa7.95□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa7.94□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 LINC01546A6NGU7 62 aa7.94□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 OR11H12B2RN74 326 aa7.94□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 TRGV3P03979 118 aa7.94□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 NDPQ00604 133 aa7.94□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 HES1Q14469 280 aa7.94□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 PIP4P1Q86T03 277 aa7.94□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 DTX2Q86UW9 622 aa7.94□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 OR11H1Q8NG94 326 aa7.94□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 OR11H2Q8NH07 326 aa7.94□□□□□ -1.14
VWA3B-217ENST00000489630 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms