RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DPH3P1Q9H4G8 78 aa13.25□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGF2-ASQ6U949 168 aa13.25□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBE2E1P51965 193 aa13.24□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEC11AP67812 179 aa13.24□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TEX36Q5VZQ5 186 aa13.24□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa13.24□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C10orf91Q5T1B1 145 aa13.24□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MED12LQ86YW9 2145 aa13.24□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DLEU1O43261 78 aa13.24□□□□□ -0.29
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CTSZQ9UBR2 303 aa13.24□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DKK4Q9UBT3 224 aa13.22□□□□□ -0.29
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A8MWV9 139 aa13.22□□□□□ -0.29
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DSCR9P59020 149 aa13.22□□□□□ -0.29
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A8MWP6 167 aa13.22□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV2-5P01817 119 aa13.22□□□□□ -0.29
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAGE2BQ13066 116 aa13.21□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAGE2EQ4V326 116 aa13.21□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa13.21□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAGE2DQ9UEU5 116 aa13.21□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR9G4Q8NGQ1 327 aa13.21□□□□□ -0.29
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRR20AP86496 221 aa13.21□□□□□ -0.3
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAGE13Q4V321 117 aa13.21□□□□□ -0.3
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C17orf77Q96MU5 243 aa13.2□□□□□ -0.3
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV1-69P01742 117 aa13.19□□□□□ -0.3
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM223AQ8IWN6 122 aa13.18□□□□□ -0.3
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBMY1CP0DJD4 496 aa13.18□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa13.18□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HLA-DMBP28068 263 aa13.18□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM104BQ5XKR9 115 aa13.18□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa13.17□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNHG12Q9BXW3 62 aa13.17□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MALP21145 153 aa13.17□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa13.17□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POU2AF1Q16633 256 aa13.17□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZFAND6Q6FIF0 208 aa13.17□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C8orf86Q6ZUL3 223 aa13.17□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF492Q9P255 531 aa13.17□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF415Q09FC8 603 aa13.17□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GFRA4Q9GZZ7 299 aa13.17□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLC7A0M8Q6 106 aa13.16□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa13.16□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 XCL2Q9UBD3 114 aa13.16□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa13.16□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 K7EN84 100 aa13.16□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GHRHP01286 108 aa13.16□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC01356Q8N9X3 169 aa13.16□□□□□ -0.3
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