RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481875.1

GARNL3-217, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-217ENST00000481875 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.36□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 SLC17A3O00476 420 aa8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 SOCS3O14543 225 aa8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 PDE6HQ13956 83 aa8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 RNF182Q8N6D2 247 aa8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 MUC4Q99102 2169 aa8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.34□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF253O75346 499 aa8.34□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 NDUFB4O95168 129 aa8.34□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 HLA-DMBP28068 263 aa8.34□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 ICAM4Q14773 271 aa8.34□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 PSG3Q16557 428 aa8.34□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.34□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF738Q8NE65 137 aa8.34□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 C20orf173Q96LM9 149 aa8.34□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 PRELID1Q9Y255 219 aa8.34□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 X6R8D5 127 aa8.34□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.33□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.33□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.33□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 PGPA6NDG6 321 aa8.33□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 IGLL5B9A064 214 aa8.33□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 DEFB4AO15263 64 aa8.33□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 PPT1P50897 306 aa8.33□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.33□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.33□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 SUN5Q8TC36 379 aa8.33□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 Q9H3A6 140 aa8.33□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 OTORQ9NRC9 128 aa8.33□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 CSN1S1P47710 185 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 UBE2G2P60604 165 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 CCL20P78556 96 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 CST9LP1Q5W188 147 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 EBLN2Q6P2I7 272 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 CMTM2Q8TAZ6 248 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 DNAH2Q9P225 4427 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 A0A1W2PRE2 83 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 KNCNA6PVL3 124 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 M0R3E3 92 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 PAGE4O60829 102 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 AMBPP02760 352 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 DEFB1P60022 68 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 RAB14P61106 215 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 NEU1Q99519 415 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 GNG13Q9P2W3 67 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 F6UB75 175 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 IFNA1P01562 189 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 FOXI2Q6ZQN5 318 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 Q6ZTC4 211 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF767PQ75MW2 155 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 A0A1B0GVY2 172 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 FAM74A7A6NL05 159 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 PRAC2D3DTV9 90 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 IGKV3-20P01619 116 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 IFITM2Q01629 132 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 OR4B1Q8NGF8 309 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 OR8A1Q8NGG7 326 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 MANBALQ9NQG1 85 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 A0A0J9YX75 114 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 GGTLC3B5MD39 225 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 H3BMM0 161 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 P0DMU3 169 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 FAM231AP0DMU4 169 aa8.28□□□□□ -1.08
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