RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466635.1

SYP-203, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 4

Gene SYP, Length 513 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-203ENST00000466635 TCEAL7Q9BRU2 100 aa9.85□□□□□ -0.83
SYP-203ENST00000466635 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa9.85□□□□□ -0.83
SYP-203ENST00000466635 MANBALQ9NQG1 85 aa9.85□□□□□ -0.83
SYP-203ENST00000466635 GNG13Q9P2W3 67 aa9.85□□□□□ -0.83
SYP-203ENST00000466635 XCL2Q9UBD3 114 aa9.85□□□□□ -0.83
SYP-203ENST00000466635 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa9.85□□□□□ -0.83
SYP-203ENST00000466635 TCRAP04437 139 aa9.84□□□□□ -0.83
SYP-203ENST00000466635 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
SYP-203ENST00000466635 CT45A10P0DMU9 189 aa9.84□□□□□ -0.83
SYP-203ENST00000466635 ZNF138P52744 262 aa9.84□□□□□ -0.83
SYP-203ENST00000466635 GNG5P63218 68 aa9.84□□□□□ -0.83
SYP-203ENST00000466635 CCL20P78556 96 aa9.84□□□□□ -0.83
SYP-203ENST00000466635 DEFB135Q30KP9 77 aa9.84□□□□□ -0.83
SYP-203ENST00000466635 ZNF680Q8NEM1 530 aa9.84□□□□□ -0.83
SYP-203ENST00000466635 RNF183Q96D59 192 aa9.84□□□□□ -0.83
SYP-203ENST00000466635 VGLL1Q99990 258 aa9.84□□□□□ -0.83
SYP-203ENST00000466635 ATG101Q9BSB4 218 aa9.84□□□□□ -0.83
SYP-203ENST00000466635 M0R2Z0 102 aa9.83□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 CDKN1BP46527 198 aa9.83□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 PMS2P11Q13670 270 aa9.83□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.83□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa9.83□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 HIST1H2BAQ96A08 127 aa9.83□□□□□ -0.84
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SYP-203ENST00000466635 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 C11orf94C9JXX5 98 aa9.82□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 PEX7O00628 323 aa9.82□□□□□ -0.84
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SYP-203ENST00000466635 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa9.82□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 TXNDC17Q9BRA2 123 aa9.82□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 RETNQ9HD89 108 aa9.82□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 ZNF492Q9P255 531 aa9.82□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa9.82□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 LENEPQ9Y5L5 61 aa9.82□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.81□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 NMBP08949 121 aa9.81□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 ATP5G3P48201 142 aa9.81□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.81□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 RARRES2Q99969 163 aa9.81□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 NDFIP1Q9BT67 221 aa9.81□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.8□□□□□ -0.84
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SYP-203ENST00000466635 TMEM75Q8N9X5 138 aa9.8□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 OR11H2Q8NH07 326 aa9.8□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 LYPD6BQ8NI32 183 aa9.8□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 Q8TAT8 98 aa9.8□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.8□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 TMEM208Q9BTX3 173 aa9.8□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 VAX2Q9UIW0 290 aa9.8□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 U3KQK5 164 aa9.8□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.79□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa9.79□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 J3KRW8 73 aa9.79□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 CRXO43186 299 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 CRISP2P16562 243 aa9.79□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 RAB14P61106 215 aa9.79□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.79□□□□□ -0.84
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SYP-203ENST00000466635 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
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SYP-203ENST00000466635 AKR1C3P42330 323 aa9.78□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 UBE2G1P62253 170 aa9.78□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa9.78□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 GFI1BQ5VTD9 330 aa9.78□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 PRNTQ86SH4 94 aa9.78□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 TMEM256Q8N2U0 113 aa9.78□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 FMC1Q96HJ9 113 aa9.78□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 SGK494Q96LW2 274 aa9.78□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 LINC00479Q96M42 142 aa9.78□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.78□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 TREM1Q9NP99 234 aa9.78□□□□□ -0.84
SYP-203ENST00000466635 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
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SYP-203ENST00000466635 TRAV34A0A0B4J273 112 aa9.77□□□□□ -0.85
SYP-203ENST00000466635 C7orf71A4D174 169 aa9.77□□□□□ -0.85
SYP-203ENST00000466635 RBFOX3A6NFN3 312 aa9.77□□□□□ -0.85
SYP-203ENST00000466635 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.77□□□□□ -0.85
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SYP-203ENST00000466635 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.77□□□□□ -0.85
SYP-203ENST00000466635 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.77□□□□□ -0.85
SYP-203ENST00000466635 LINC01587Q99440 93 aa9.77□□□□□ -0.85
SYP-203ENST00000466635 NEU1Q99519 415 aa9.77□□□□□ -0.85
SYP-203ENST00000466635 KLF12Q9Y4X4 402 aa9.77□□□□□ -0.85
SYP-203ENST00000466635 AGRNO00468 2067 aa9.77□□□□□ -0.85
SYP-203ENST00000466635 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa9.76□□□□□ -0.85
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SYP-203ENST00000466635 H7BYZ3 331 aa9.76□□□□□ -0.85
SYP-203ENST00000466635 IGLV2-11P01706 119 aa9.76□□□□□ -0.85
SYP-203ENST00000466635 MIFP14174 115 aa9.76□□□□□ -0.85
SYP-203ENST00000466635 KIR3DS1Q14943 382 aa9.76□□□□□ -0.85
SYP-203ENST00000466635 TMEM183BQ1AE95 376 aa9.76□□□□□ -0.85
SYP-203ENST00000466635 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
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