RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464495.4

SOGA3-204, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene SOGA3, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-204ENST00000464495 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 FABP12A6NFH5 140 aa6.41□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 DISC1C4P0D8 188 aa6.41□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 LECT2O14960 151 aa6.41□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 IGHV3-30P01768 117 aa6.41□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 IGHV3-33P01772 117 aa6.41□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 GPX1P07203 203 aa6.41□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.41□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.41□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 IAPPP10997 89 aa6.41□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
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SOGA3-204ENST00000464495 ZNF846Q147U1 533 aa6.41□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 LINC01620Q4KN68 170 aa6.41□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 TMEM229BQ8NBD8 167 aa6.41□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.41□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 ARL6Q9H0F7 186 aa6.41□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.41□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.41□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 LRP2P98164 4655 aa6.4□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 FAM25AB3EWG3 89 aa6.4□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 FAM25CB3EWG5 89 aa6.4□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 FAM25GB3EWG6 89 aa6.4□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 PRAC2D3DTV9 90 aa6.4□□□□□ -1.38
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SOGA3-204ENST00000464495 C4orf46Q504U0 113 aa6.4□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.4□□□□□ -1.38
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SOGA3-204ENST00000464495 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.4□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 RMI2Q96E14 147 aa6.4□□□□□ -1.38
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SOGA3-204ENST00000464495 ARV1Q9H2C2 271 aa6.4□□□□□ -1.38
SOGA3-204ENST00000464495 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.39□□□□□ -1.39
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SOGA3-204ENST00000464495 KLLNB2CW77 178 aa6.39□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 SFTA3P0C7M3 94 aa6.39□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.39□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.39□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.39□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.39□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 OR52I2Q8NH67 350 aa6.39□□□□□ -1.39
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SOGA3-204ENST00000464495 LINC00477Q96M19 166 aa6.39□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.39□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.38□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 PRSS46E5RG02 174 aa6.38□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 WRBO00258 174 aa6.38□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 NMBP08949 121 aa6.38□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
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SOGA3-204ENST00000464495 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 BTN1A1Q13410 526 aa6.38□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 WFDC2Q14508 124 aa6.38□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 OPCMLQ14982 345 aa6.38□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.38□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 MZT2AQ6P582 158 aa6.38□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.38□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.38□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.38□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 NRG4Q8WWG1 115 aa6.38□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 ZNF479Q96JC4 524 aa6.38□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 PRRT1Q99946 306 aa6.38□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 PAXXQ9BUH6 204 aa6.38□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 SRRQ9GZT4 340 aa6.38□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 RAB26Q9ULW5 256 aa6.38□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 GPR132Q9UNW8 380 aa6.38□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.38□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.37□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 A0A0D9SG52 128 aa6.37□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 GGTLC3B5MD39 225 aa6.37□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 SLC17A3O00476 420 aa6.37□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 GOSR2O14653 212 aa6.37□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 SYNGR2O43760 224 aa6.37□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 COX7A2P2O60397 106 aa6.37□□□□□ -1.39
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SOGA3-204ENST00000464495 GAS8-AS1O95177 125 aa6.37□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 SEC11BP0C7V7 166 aa6.37□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 CD300CQ08708 224 aa6.37□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 NEDD8Q15843 81 aa6.37□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 LELP1Q5T871 98 aa6.37□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 BAALCQ8WXS3 180 aa6.37□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 RASL10AQ92737 203 aa6.37□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 YIPF6Q96EC8 236 aa6.37□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 SPXQ9BT56 116 aa6.37□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.37□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.36□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 H3BTX0 84 aa6.36□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 SLC25A6P12236 298 aa6.36□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 TGFBR1P36897 503 aa6.36□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 C14orf177Q52M58 125 aa6.36□□□□□ -1.39
SOGA3-204ENST00000464495 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.36□□□□□ -1.39
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