RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 SLC25A2Q9BXI2 301 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 BATF3Q9NR55 127 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 C7orf71A4D174 169 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 KLLNB2CW77 178 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 H3BNG1 76 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 J3KRW8 73 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 SSNA1O43805 119 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 MPC2O95563 127 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 IFNA5P01569 189 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 PET100P0DJ07 73 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 CRISP2P16562 243 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 H2BFSP57053 126 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 ERCC8Q13216 396 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 OR5I1Q13606 314 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 CLINT1Q14677 625 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 ICAM4Q14773 271 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 GCSAMLQ5JQS6 135 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM78Q5T7P6 136 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 LYPD1Q8N2G4 141 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 SCGB1C1Q8TD33 95 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF503Q96F45 646 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 ATP5SQ99766 215 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 PAXXQ9BUH6 204 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 FUT9Q9Y231 359 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1B0GVY2 172 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 GAGE12BA1L429 117 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 GAGE7O76087 117 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 GPX1P07203 203 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 GAGE12FP0CL80 117 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 GAGE12GP0CL81 117 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 GAGE12IP0CL82 117 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 M6PRP20645 277 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 RPL12P30050 165 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 CSN1S1P47710 185 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF680Q8NEM1 530 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 RXFP4Q8TDU9 374 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 FXYD5Q96DB9 178 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 C18orf15Q96N68 181 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF492Q9P255 531 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 HSPB11Q9Y547 144 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 RBAKDNA6NC62 111 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 OR7C2O60412 319 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF138P52744 262 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 TAS2R45P59539 299 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 RANP62826 216 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 CD300CQ08708 224 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 FFAR4Q5NUL3 377 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 FAM122CQ6P4D5 195 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 VGLL1Q99990 258 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 TRGV2A0A075B6R0 118 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 RGS13O14921 159 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 SPINK4O60575 86 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 OR10J4P0C629 311 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 HOXA5P20719 270 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 TCL1AP56279 114 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 SLAQ13239 276 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 BTN1A1Q13410 526 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 KHDC3LQ587J8 217 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 Q6ZTI0 123 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 SSX7Q7RTT5 188 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 Q9H3A6 140 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 Q9H8V8 135 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 LENEPQ9Y5L5 61 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 A0A0J9YY99 117 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1W2PPV4 95 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 DIRC3C9JPN6 131 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 MED14OSP0DP75 135 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF266Q14584 549 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 ESRGQ1W209 222 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 FAM74A1Q5RGS3 127 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 PQLC2Q6ZP29 291 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRF-210ENST00000463041 C6orf223Q8N319 242 aa5.06□□□□□ -1.6
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