RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 ZNF493Q6ZR52 646 aa14.83□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 HYLS1Q96M11 299 aa14.83□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa14.82□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa14.82□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 UMAD1C9J7I0 102 aa14.82□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 BCL2L11O43521 198 aa14.82□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 GPX1P07203 203 aa14.82□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 HTN1P15515 57 aa14.82□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 GCHFRP30047 84 aa14.82□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 ZNF138P52744 262 aa14.82□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 TCTAP57738 103 aa14.82□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 IQCF2Q8IXL9 164 aa14.82□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.82□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa14.82□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 CYTL1Q9NRR1 136 aa14.82□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 TRAV10A0A0B4J240 114 aa14.81□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 SEC11BP0C7V7 166 aa14.81□□□□□ -0.04
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IMP4-209ENST00000462357 C2CD4CQ8TF44 421 aa14.81□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 C16orf74Q96GX8 76 aa14.81□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 LENEPQ9Y5L5 61 aa14.81□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 DIRC3C9JPN6 131 aa14.8□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 AKAP14Q86UN6 197 aa14.8□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.8□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.8□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 PYGO2Q9BRQ0 406 aa14.8□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 ZNF492Q9P255 531 aa14.8□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 C7orf71A4D174 169 aa14.79□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 LYRM9A8MSI8 78 aa14.79□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 J3KRW8 73 aa14.79□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 TPT1P13693 172 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.79□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 TMUB2Q71RG4 321 aa14.79□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 TMED6Q8WW62 240 aa14.79□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa14.78□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 CRISP2P16562 243 aa14.78□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 SUN5Q8TC36 379 aa14.78□□□□□ -0.04
IMP4-209ENST00000462357 DKK2Q9UBU2 259 aa14.78□□□□□ -0.04
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IMP4-209ENST00000462357 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
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IMP4-209ENST00000462357 FAM222AQ5U5X8 452 aa14.77□□□□□ -0.05
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IMP4-209ENST00000462357 C5orf17Q8NAS9 161 aa14.77□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 VGLL1Q99990 258 aa14.77□□□□□ -0.05
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IMP4-209ENST00000462357 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.77□□□□□ -0.05
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IMP4-209ENST00000462357 KLLNB2CW77 178 aa14.76□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 C1QBP02746 253 aa14.76□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 DAD1P61803 113 aa14.76□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 FAM19A4Q96LR4 140 aa14.76□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa14.75□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 SNURFLB1AK76 121 aa14.75□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 C12orf74Q32Q52 190 aa14.75□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 Q6ZTC4 211 aa14.75□□□□□ -0.05
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IMP4-209ENST00000462357 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa14.74□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 RGS13O14921 159 aa14.74□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa14.74□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa14.74□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 LCE6AA0A183 80 aa14.73□□□□□ -0.05
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IMP4-209ENST00000462357 F6UZH7 168 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 TEX46H3BTG2 121 aa14.73□□□□□ -0.05
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IMP4-209ENST00000462357 PPT1P50897 306 aa14.73□□□□□ -0.05
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IMP4-209ENST00000462357 FAM210BQ96KR6 192 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 LINC00467Q9BRT7 94 aa14.73□□□□□ -0.05
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IMP4-209ENST00000462357 CBY3A6NI87 242 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 EPDR1Q9UM22 224 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 TCRAP04437 139 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 AZU1P20160 251 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 KIR3DS1Q14943 382 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 FAM213BQ8TBF2 198 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 SFT2D1Q8WV19 159 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 TCEAL7Q9BRU2 100 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-209ENST00000462357 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
IMP4-209ENST00000462357 CD300CQ08708 224 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-209ENST00000462357 BTN1A1Q13410 526 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-209ENST00000462357 ZNF726P1Q15940 193 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-209ENST00000462357 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa14.7□□□□□ -0.06
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