RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 FUT9Q9Y231 359 aa5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 PRELID1Q9Y255 219 aa5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF680Q8NEM1 530 aa5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 THAP6Q8TBB0 222 aa5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 ODF3Q96PU9 254 aa5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 ARPC5LQ9BPX5 153 aa5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 NDUFA13Q9P0J0 144 aa5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 KLF12Q9Y4X4 402 aa5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A096LPF7 62 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 PAX4O43316 350 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF253O75346 499 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 NDUFB4O95168 129 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 OR10J4P0C629 311 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 NBEAP1P0C6P0 100 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 CSN1S1P47710 185 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 VWC2Q2TAL6 325 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 MIR17HGQ75NE6 70 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 OR5C1Q8NGR4 320 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 ENKURQ8TC29 256 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF503Q96F45 646 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 VGLL1Q99990 258 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 PAXXQ9BUH6 204 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 NPCDR1Q9BY65 106 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC25A31Q9H0C2 315 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 OR51M1Q9H341 326 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 C11orf1Q9H5F2 150 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM14CQ9P0S9 112 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 PKHD1P08F94 4074 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 E5RGE8 158 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 C17orf112F2Z3M2 114 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 H3BNG1 76 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 EREGO14944 169 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 SIVA1O15304 175 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 OR7C2O60412 319 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 RANP62826 216 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 MUC21Q5SSG8 566 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 VSIG2Q96IQ7 327 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 C8orf49Q96NF6 230 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC32Q9BV29 185 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC25A2Q9BXI2 301 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 Q9H3A6 140 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 RPH3ALQ9UNE2 315 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 ICOSQ9Y6W8 199 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.91□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 PRAF2O60831 178 aa5.91□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF138P52744 262 aa5.91□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 PDE6HQ13956 83 aa5.91□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.91□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 Q6ZQT7 251 aa5.91□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.91□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 Q8TAT8 98 aa5.91□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 HYLS1Q96M11 299 aa5.91□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 SCRT2Q9NQ03 307 aa5.91□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.91□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 HHLA3Q9XRX5 114 aa5.91□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A1W2PPQ1 181 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 KLLNB2CW77 178 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 SPINK4O60575 86 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 CDK2AP2O75956 126 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 NXPH4O95158 308 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 TCL1AP56279 114 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00315P59091 139 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 CYCSP99999 105 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF415Q09FC8 603 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 IL15RAQ13261 267 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 FFAR4Q5NUL3 377 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 PRR9Q5T870 116 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 SCGB1C1Q8TD33 95 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 CHAC2Q8WUX2 184 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 S100ZQ8WXG8 99 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 UPK3BQ9BT76 320 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 SMIM3Q9BZL3 60 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 KCNIP2Q9NS61 270 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF492Q9P255 531 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 PRO0255Q9UI72 69 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 NAGKQ9UJ70 344 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP1-204ENST00000459646 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1-204ENST00000459646 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1-204ENST00000459646 SSNA1O43805 119 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms