RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448332.1

CXorf40A-210, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXorf40A, Length 364 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-210ENST00000448332 A0A1W2PPV4 95 aa13.01□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 PLAC8L1A1L4L8 177 aa13.01□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 C7orf71A4D174 169 aa13.01□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 ZNF266Q14584 549 aa13.01□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 FCN2Q15485 313 aa13.01□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 FXYD5Q96DB9 178 aa13.01□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 PHYHIPLQ96FC7 376 aa13.01□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 CBY3A6NI87 242 aa13□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 GPX1P07203 203 aa13□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 RANP62826 216 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 FAM74A1Q5RGS3 127 aa12.99□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 LYPD1Q8N2G4 141 aa12.99□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 ZNF680Q8NEM1 530 aa12.99□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 ASB13Q8WXK3 278 aa12.99□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 ATG101Q9BSB4 218 aa12.99□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa12.99□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 KMT2AQ03164 3969 aa12.99□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 M6PRP20645 277 aa12.98□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 BTN1A1Q13410 526 aa12.98□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa12.98□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 CMTM2Q8TAZ6 248 aa12.98□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 Q9H3A6 140 aa12.98□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 KLLNB2CW77 178 aa12.97□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 RGS13O14921 159 aa12.97□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 NUDT3O95989 172 aa12.97□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 GIPP09681 153 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 ZNF138P52744 262 aa12.97□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 RGS21Q2M5E4 152 aa12.97□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 PQLC2Q6ZP29 291 aa12.97□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa12.97□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 WFDC1Q9HC57 220 aa12.97□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 BIRC6Q9NR09 4857 aa12.96□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 GAGE12BA1L429 117 aa12.96□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 GAGE7O76087 117 aa12.96□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 NMBP08949 121 aa12.96□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 GAGE12FP0CL80 117 aa12.96□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 GAGE12GP0CL81 117 aa12.96□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 GAGE12IP0CL82 117 aa12.96□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 CRISP2P16562 243 aa12.96□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 RAB2AP61019 212 aa12.96□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 OR10G4Q8NGN3 311 aa12.96□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 OR10G9Q8NGN4 311 aa12.96□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 OR10G7Q8NGN6 311 aa12.96□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 RXFP4Q8TDU9 374 aa12.96□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 AQP10Q96PS8 301 aa12.96□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 VGLL1Q99990 258 aa12.96□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 ARPC5LQ9BPX5 153 aa12.96□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 RPH3ALQ9UNE2 315 aa12.96□□□□□ -0.33
CXorf40A-210ENST00000448332 VPS13DQ5THJ4 4388 aa12.95□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 CD300CQ08708 224 aa12.95□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 RNF212Q495C1 297 aa12.95□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 Q8TAT8 98 aa12.95□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 FAM19A4Q96LR4 140 aa12.95□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 HYLS1Q96M11 299 aa12.95□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 ZNF492Q9P255 531 aa12.95□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa12.94□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 RBAKDNA6NC62 111 aa12.94□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 OR5I1Q13606 314 aa12.94□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 ZNF503Q96F45 646 aa12.94□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 TRGV2A0A075B6R0 118 aa12.93□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa12.93□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 M0R2N4 97 aa12.93□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP12.93□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 OTORQ9NRC9 128 aa12.93□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 DNAH6Q9C0G6 4158 aa12.92□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa12.92□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa12.92□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 MBP02144 154 aa12.92□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa12.92□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 OR2G3Q8NGZ4 309 aa12.92□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 LINC00467Q9BRT7 94 aa12.92□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa12.92□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa12.91□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 PGPA6NDG6 321 aa12.91□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 DIRC3C9JPN6 131 aa12.91□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 CCL18P55774 89 aa12.91□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa12.91□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 LINC00336Q6ZUF6 198 aa12.91□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 OR2T35Q8NGX2 323 aa12.91□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa12.9□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 ARL14EPLP0DKL9 152 aa12.9□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 ATP6V0CP27449 155 aa12.9□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 ZNF415Q09FC8 603 aa12.9□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 PRR9Q5T870 116 aa12.9□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 Q6ZTI0 123 aa12.9□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 LINC00612Q8N6U2 182 aa12.9□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 LENEPQ9Y5L5 61 aa12.9□□□□□ -0.34
CXorf40A-210ENST00000448332 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa12.89□□□□□ -0.35
CXorf40A-210ENST00000448332 TCL1AP56279 114 aa12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms