RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 PINLYPA6NC86 204 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 GAGE12JA6NER3 117 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 GAGE7O76087 117 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 GAGE12FP0CL80 117 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 GAGE12GP0CL81 117 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 GAGE12IP0CL82 117 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 CKS2P33552 79 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 MPV17P39210 176 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 GAGE4Q13068 117 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D28Q2M2D7 210 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 GATD1Q8NB37 220 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 E7EUB6 86 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHG3P01860 377 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 PLA2G2AP14555 144 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB109BQ30KR1 87 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC140Q96MF4 163 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV2-11P01706 119 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 ORM1P02763 201 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 IL4P05112 153 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 LEPP41159 167 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 RPEQ96AT9 228 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 C17orf100A8MU93 164 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 DPM2O94777 84 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 EVI2AP22794 236 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 PRTN3P24158 256 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 MEOX1P50221 254 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 AJUBAQ96IF1 538 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 RITA1Q96K30 269 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 H3BVH4 76 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF688P0C7X2 276 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 GP9P14770 177 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 GLRXP35754 106 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 TAL2Q16559 108 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 CALYQ9NYX4 217 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 U3KQK5 164 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 IQCF6A8MYZ5 107 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 POU2AF1Q16633 256 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 TEN1Q86WV5 123 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC01549A6NIU2 74 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 SHISA9B4DS77 424 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 SPRY2O43597 315 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 CRIP1P50238 77 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 GAGE2BQ13066 116 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 TWIST1Q15672 202 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 GAGE2EQ4V326 116 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
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RABGEF1-203ENST00000439720 TTTY12Q9BZ98 90 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
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RABGEF1-203ENST00000439720 RHODO00212 210 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 GAS8-AS1O95177 125 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 WT1-ASQ06250 92 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF415Q09FC8 603 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC32Q5I0X7 151 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMG4Q5JS54 123 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A087WX48 190 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXL15Q9H469 300 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-203ENST00000439720 OTORQ9NRC9 128 aa6.58□□□□□ -1.36
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