RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 SEC11CQ9BY50 192 aa12.57□□□□□ -0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa12.57□□□□□ -0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 C19orf73Q9NVV2 129 aa12.57□□□□□ -0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZFP30Q9Y2G7 519 aa12.57□□□□□ -0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 LENEPQ9Y5L5 61 aa12.57□□□□□ -0.4
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TOP3BP1-201ENST00000420768 C10orf91Q5T1B1 145 aa12.54□□□□□ -0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR4B1Q8NGF8 309 aa12.54□□□□□ -0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q8TAT8 98 aa12.54□□□□□ -0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM183AQ8IXX5 376 aa12.53□□□□□ -0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM19A4Q96LR4 140 aa12.53□□□□□ -0.4
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TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP10-11P60412 298 aa12.52□□□□□ -0.41
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TOP3BP1-201ENST00000420768 Q8N1Y9 231 aa12.52□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 SDF2L1Q9HCN8 221 aa12.52□□□□□ -0.41
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CRISP2P16562 243 aa12.51□□□□□ -0.41
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TOP3BP1-201ENST00000420768 LEPP41159 167 aa12.51□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 DEFB125Q8N687 156 aa12.51□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 OCC1Q8TAD7 63 aa12.51□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 TVP23CQ96ET8 276 aa12.51□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 WFDC10AQ9H1F0 79 aa12.51□□□□□ -0.41
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa12.5□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGKV3-20P01619 116 aa12.5□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 AMTNQ6UX39 209 aa12.5□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC01551Q86U37 167 aa12.5□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 PGPEP1LA6NFU8 196 aa12.49□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMUG1Q53HV7 270 aa12.49□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 NHLRC2Q8NBF2 726 aa12.49□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 GCGP01275 180 aa12.48□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 MGST1P10620 155 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDKN1BP46527 198 aa12.48□□□□□ -0.41
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa12.48□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 C8orf49Q96NF6 230 aa12.48□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 ASCL2Q99929 193 aa12.48□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 SRD5A3Q9H8P0 318 aa12.48□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLLNB2CW77 178 aa12.47□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 K7EN84 100 aa12.47□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP6V1G1O75348 118 aa12.47□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 APOC3P02656 99 aa12.47□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 AMBPP02760 352 aa12.47□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPX1P07203 203 aa12.47□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADIRFQ15847 76 aa12.47□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 SVBPQ8N300 66 aa12.47□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa12.47□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 S100A1P23297 94 aa12.46□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPINK13Q1W4C9 94 aa12.46□□□□□ -0.41
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