RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 PRR9Q5T870 116 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXL15Q9H469 300 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 RABAC1Q9UI14 185 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 PPIAL4GP0DN37 164 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 PRSS57Q6UWY2 283 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC140Q96MF4 163 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 CUBNO60494 3623 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 SOCS3O14543 225 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 BPIFB3P59826 476 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 PRR27Q6MZM9 219 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 COX7A2P2O60397 106 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 MGST1P10620 155 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 Q6AWC8 147 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 PGLYRP4Q96LB8 373 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 VGLL1Q99990 258 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM191AQ9H0A3 160 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 LYNX1G3V0Z9 82 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 TIMM23O14925 209 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 SNAI2O43623 268 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 BUB3O43684 328 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFS7O75251 213 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 LYNX1P0DP58 116 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 LYZL1Q6UWQ5 148 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM19A4Q96LR4 140 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 P01737 135 aa2.78□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 ORM2P19652 201 aa2.78□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 FXYD2P54710 66 aa2.78□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM97Q5BJF2 176 aa2.78□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 ERASQ7Z444 233 aa2.78□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF502Q8TBZ5 544 aa2.78□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 C8orf49Q96NF6 230 aa2.78□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 FASNP49327 2511 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 TCF15Q12870 199 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB9BQ9NP90 201 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 NPIPB5A8MRT5 1133 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 D6R8Y8 96 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 SIVA1O15304 175 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 NXPH4O95158 308 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 ERHP84090 104 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 VMA21Q3ZAQ7 101 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 E9PLD3 99 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 APOA2P02652 100 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 C5orf64Q2M2E5 130 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 DKK2Q9UBU2 259 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 GAGE12BA1L429 117 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 SEC11AP67812 179 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC9CQ8N5M4 171 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 SMPXQ9UHP9 88 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 HLA-DMBP28068 263 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM180AQ6UWF9 173 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 C12orf54Q6X4T0 127 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC01548A6NM66 108 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 PRTN3P24158 256 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXC12P31275 282 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR183P32249 361 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 FHL3Q13643 280 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 C7orf71A4D174 169 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 COL8A1P27658 744 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 DEFB124Q8NES8 71 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 HLA-DRB4P13762 266 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM108Q6UXF1 575 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 BLNKQ8WV28 456 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 SERTAD4Q9NUC0 356 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 K7EP34 96 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 TSHBP01222 138 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 BATFQ16520 125 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 DEFB109BQ30KR1 87 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 Q8TAT8 98 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 SIRPDQ9H106 197 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 HIGD1AQ9Y241 93 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 EVI2AP22794 236 aa2.76□□□□□ -1.97
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