RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 SOCS3O14543 225 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP5-204ENST00000412806 COX19Q49B96 90 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP5-204ENST00000412806 C20orf173Q96LM9 149 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP5-204ENST00000412806 GFRA4Q9GZZ7 299 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP5-204ENST00000412806 RAB4BP61018 213 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP5-204ENST00000412806 Q6ZSV7 163 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP5-204ENST00000412806 KLHDC1Q8N7A1 406 aa16.39■□□□□ 0.21
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SH3BP5-204ENST00000412806 C18orf65Q6ZTR6 163 aa16.38■□□□□ 0.21
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SH3BP5-204ENST00000412806 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa16.37■□□□□ 0.21
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SH3BP5-204ENST00000412806 S100A8P05109 93 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP5-204ENST00000412806 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
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SH3BP5-204ENST00000412806 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa16.35■□□□□ 0.21
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SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.21
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SH3BP5-204ENST00000412806 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa16.31■□□□□ 0.2
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SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM256Q8N2U0 113 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP5-204ENST00000412806 HIST1H2BLQ99880 126 aa16.3■□□□□ 0.2
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SH3BP5-204ENST00000412806 C4orf3Q8WVX3 66 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP5-204ENST00000412806 C12orf57Q99622 126 aa16.29■□□□□ 0.2
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SH3BP5-204ENST00000412806 DCANP1Q8TF63 244 aa16.29■□□□□ 0.2
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SH3BP5-204ENST00000412806 F2Z2F3 143 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP5-204ENST00000412806 AMBPP02760 352 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP5-204ENST00000412806 SRIP30626 198 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP5-204ENST00000412806 SCGB2A2Q13296 93 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF575Q86XF7 245 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A1B0GUT8 65 aa16.27■□□□□ 0.19
SH3BP5-204ENST00000412806 F6UB75 175 aa16.27■□□□□ 0.19
SH3BP5-204ENST00000412806 LINC01619G3V211 115 aa16.27■□□□□ 0.19
SH3BP5-204ENST00000412806 LY6G6DO95868 133 aa16.27■□□□□ 0.19
SH3BP5-204ENST00000412806 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
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