RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 C5orf17Q8NAS9 161 aa5□□□□□ -1.61
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CCL20-202ENST00000409189 YPEL4Q96NS1 127 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-202ENST00000409189 GPR82Q96P67 336 aa5□□□□□ -1.61
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CCL20-202ENST00000409189 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa4.99□□□□□ -1.61
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CCL20-202ENST00000409189 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa4.98□□□□□ -1.61
CCL20-202ENST00000409189 A0A087X0K7 114 aa4.98□□□□□ -1.61
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CCL20-202ENST00000409189 GCGP01275 180 aa4.96□□□□□ -1.62
CCL20-202ENST00000409189 LTAP01374 205 aa4.96□□□□□ -1.62
CCL20-202ENST00000409189 TYMSP04818 313 aa4.96□□□□□ -1.62
CCL20-202ENST00000409189 CLEC3BP05452 202 aa4.96□□□□□ -1.62
CCL20-202ENST00000409189 PSMB8P28062 276 aa4.96□□□□□ -1.62
CCL20-202ENST00000409189 ARL3P36405 182 aa4.96□□□□□ -1.62
CCL20-202ENST00000409189 RANP62826 216 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
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