RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
ODC1-202ENST00000405333 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa15.08■□□□□ 0
ODC1-202ENST00000405333 B4DEV8 164 aa15.07■□□□□ 0
ODC1-202ENST00000405333 S100A9P06702 114 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
ODC1-202ENST00000405333 PSMG4Q5JS54 123 aa15.07■□□□□ 0
ODC1-202ENST00000405333 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa15.07■□□□□ 0
ODC1-202ENST00000405333 SFRP2Q96HF1 295 aa15.07■□□□□ 0
ODC1-202ENST00000405333 GCGP01275 180 aa15.07■□□□□ 0
ODC1-202ENST00000405333 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
ODC1-202ENST00000405333 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa15.06■□□□□ 0
ODC1-202ENST00000405333 GDF5OSQ5U4N7 250 aa15.06■□□□□ 0
ODC1-202ENST00000405333 TMEM183AQ8IXX5 376 aa15.06■□□□□ 0
ODC1-202ENST00000405333 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa15.06■□□□□ 0
ODC1-202ENST00000405333 A0A087WWC5 75 aa15.05■□□□□ 0
ODC1-202ENST00000405333 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa15.05■□□□□ 0
ODC1-202ENST00000405333 ID1P41134 155 aa15.05■□□□□ 0
ODC1-202ENST00000405333 CLEC5AQ9NY25 188 aa15.05■□□□□ 0
ODC1-202ENST00000405333 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa15.05■□□□□ 0
ODC1-202ENST00000405333 ERVFC1-1P60608 527 aa15.05■□□□□ -0
ODC1-202ENST00000405333 PRR25Q96S07 402 aa15.05■□□□□ -0
ODC1-202ENST00000405333 RBAKDNA6NC62 111 aa15.04■□□□□ -0
ODC1-202ENST00000405333 MT-ND4LP03901 98 aa15.04■□□□□ -0
ODC1-202ENST00000405333 CD33P20138 364 aa15.04■□□□□ -0
ODC1-202ENST00000405333 PAFAH1B2P68402 229 aa15.04■□□□□ -0
ODC1-202ENST00000405333 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa15.04■□□□□ -0
ODC1-202ENST00000405333 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
ODC1-202ENST00000405333 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
ODC1-202ENST00000405333 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa15.04■□□□□ -0
ODC1-202ENST00000405333 OR8A1Q8NGG7 326 aa15.04■□□□□ -0
ODC1-202ENST00000405333 ZFP30Q9Y2G7 519 aa15.04■□□□□ -0
ODC1-202ENST00000405333 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
ODC1-202ENST00000405333 CRIP1P50238 77 aa15.03■□□□□ -0
ODC1-202ENST00000405333 ZNF124Q15973 351 aa15.03■□□□□ -0
ODC1-202ENST00000405333 SAMD13Q5VXD3 122 aa15.02■□□□□ -0
ODC1-202ENST00000405333 OR10G8Q8NGN5 311 aa15.02■□□□□ -0
ODC1-202ENST00000405333 H7BYZ3 331 aa15.02□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 CA1P00915 261 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 TMEM78Q5T7P6 136 aa15.02□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 OR10J6PQ8NGY7 276 aa15.02□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 SMIM12Q96EX1 92 aa15.02□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 SMCO4Q9NRQ5 59 aa15.02□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 IGLV1-51P01701 117 aa15.01□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 CT45A10P0DMU9 189 aa15.01□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 ZNF138P52744 262 aa15.01□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 NUDT10Q8NFP7 164 aa15.01□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 NUDT11Q96G61 164 aa15.01□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 ZNF492Q9P255 531 aa15.01□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 V9GYV3 84 aa15.01□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 NPIPB6E9PJ23 425 aa15□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 DEFB131AP59861 70 aa15□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 TMEM242Q9NWH2 141 aa15□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 Q6ZQT7 251 aa15□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 C3orf56Q8N813 242 aa15□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 ANAPC16Q96DE5 110 aa15□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 ZNF747Q9BV97 191 aa15□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 CTDSP1Q9GZU7 261 aa15□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa14.99□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 C19orf71A6NCJ1 209 aa14.99□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 J3KRW8 73 aa14.99□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 IGKV3-20P01619 116 aa14.99□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa14.99□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 OSTCQ9NRP0 149 aa14.99□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 KIR3DS1Q14943 382 aa14.98□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 PRR9Q5T870 116 aa14.98□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 APRG1Q8IVJ8 170 aa14.98□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 YPEL4Q96NS1 127 aa14.98□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 MAP6D1Q9H9H5 199 aa14.98□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 TRAV2A0A0B4J234 112 aa14.98□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 TRAV25A0A0B4J276 109 aa14.98□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 A0A0J9YX75 114 aa14.98□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 KNCNA6PVL3 124 aa14.98□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 C15orf54Q8N8G6 183 aa14.98□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 OR4C46A6NHA9 309 aa14.97□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 ELOBQ15370 118 aa14.97□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 ODF3L2Q3SX64 289 aa14.97□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 RPL19P84098 196 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 FAM231DQ6ZW35 169 aa14.96□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 LINC00477Q96M19 166 aa14.96□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 NDFIP1Q9BT67 221 aa14.96□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ODC1-202ENST00000405333 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa14.96□□□□□ -0.02
ODC1-202ENST00000405333 COLCA2A8K830 154 aa14.96□□□□□ -0.02
ODC1-202ENST00000405333 PPP1R2P9O14990 202 aa14.96□□□□□ -0.02
ODC1-202ENST00000405333 ACTL10Q5JWF8 245 aa14.96□□□□□ -0.02
ODC1-202ENST00000405333 C12orf54Q6X4T0 127 aa14.96□□□□□ -0.02
ODC1-202ENST00000405333 COX8CQ7Z4L0 72 aa14.96□□□□□ -0.02
ODC1-202ENST00000405333 TMEM158Q8WZ71 300 aa14.96□□□□□ -0.02
ODC1-202ENST00000405333 TUBA4BQ9H853 241 aa14.96□□□□□ -0.02
ODC1-202ENST00000405333 SH2D1AO60880 128 aa14.95□□□□□ -0.02
ODC1-202ENST00000405333 PFN1P07737 140 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ODC1-202ENST00000405333 CXCL1P09341 107 aa14.95□□□□□ -0.02
ODC1-202ENST00000405333 TCL1AP56279 114 aa14.95□□□□□ -0.02
ODC1-202ENST00000405333 SMUG1Q53HV7 270 aa14.95□□□□□ -0.02
ODC1-202ENST00000405333 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms