RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 WFDC12Q8WWY7 111 aa13.03□□□□□ -0.32
CTDSP2-201ENST00000398073 PLEKHB2Q96CS7 222 aa13.03□□□□□ -0.32
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF747Q9BV97 191 aa13.03□□□□□ -0.32
CTDSP2-201ENST00000398073 SCGB1A1P11684 91 aa13.02□□□□□ -0.32
CTDSP2-201ENST00000398073 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa13.02□□□□□ -0.32
CTDSP2-201ENST00000398073 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa13.02□□□□□ -0.32
CTDSP2-201ENST00000398073 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa13.02□□□□□ -0.32
CTDSP2-201ENST00000398073 NPYP01303 97 aa13.02□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 IGHV4-39P01824 125 aa13.02□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP6V0E1O15342 81 aa13.01□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF688P0C7X2 276 aa13.01□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa13.01□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 OR13C6PQ8NH95 151 aa13.01□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 H3BUX3 64 aa13.01□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa13.01□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 C10orf126Q8N4M7 172 aa13.01□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF876PQ49A33 203 aa13.01□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 IL17RELQ6ZVW7 336 aa13.01□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa13.01□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa13.01□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 UBE2E1P51965 193 aa13.01□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 SPRNQ5BIV9 151 aa13.01□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 PATE2Q6UY27 113 aa13.01□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 MORN5Q5VZ52 161 aa13□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 GTSF1LQ9H1H1 148 aa13□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa13□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 IGFL2Q6UWQ7 119 aa13□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa13□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 FCN3O75636 299 aa13□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 CTSZQ9UBR2 303 aa13□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 BRD3OSQ6XYD6 125 aa13□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 GP9P14770 177 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 C2orf66Q6UXQ4 117 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 K7EP13 123 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 SIVA1O15304 175 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 K7EP34 96 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 YPEL4Q96NS1 127 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 DKK4Q9UBT3 224 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 SPRY4Q9C004 299 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 TOMM7Q9P0U1 55 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM120AOSQ5T036 256 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 C17orf77Q96MU5 243 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 BPESC1Q9GZL8 116 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 CR1LQ2VPA4 569 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 DEFB125Q8N687 156 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa12.97□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 C8orf86Q6ZUL3 223 aa12.97□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 ANAPC13Q9BS18 74 aa12.97□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 INS-IGF2F8WCM5 200 aa12.97□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 DTX2Q86UW9 622 aa12.97□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 VGLL1Q99990 258 aa12.97□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 NDUFS7O75251 213 aa12.96□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 MED12LQ86YW9 2145 aa12.96□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 M0R2P5 195 aa12.96□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa12.96□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 TNCP24821 2201 aa12.96□□□□□ -0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 C22orf46C9J442 243 aa12.96□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 TRGV2A0A075B6R0 118 aa12.96□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 G3V318 75 aa12.96□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 OVOL3O00110 214 aa12.96□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 Q6ZVH6 145 aa12.96□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa12.95□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A087WWL8 130 aa12.95□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa12.95□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A1W2PPM0 123 aa12.95□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 NDUFS8O00217 210 aa12.95□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 SMIM2Q9BVW6 85 aa12.95□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 KLF12Q9Y4X4 402 aa12.95□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 IGKV1-17P01599 117 aa12.94□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 STHQ8IWL8 128 aa12.94□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 F8VRH5 84 aa12.94□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa12.94□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 BRWD1-AS2P59051 145 aa12.94□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 LY6DQ14210 128 aa12.94□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 PIP4P1Q86T03 277 aa12.94□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa12.94□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa12.94□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 GAGE2BQ13066 116 aa12.94□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 GAGE2EQ4V326 116 aa12.94□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 GAGE2DQ9UEU5 116 aa12.94□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 B4DSR2 109 aa12.93□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 CCL25O15444 150 aa12.93□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 WT1P19544 449 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 TAL2Q16559 108 aa12.93□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 DKK2Q9UBU2 259 aa12.93□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa12.93□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 PROP1O75360 226 aa12.93□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 LINC01545Q5VT33 79 aa12.93□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 ATXN8Q156A1 80 aa12.93□□□□□ -0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 Q5PR19 223 aa12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms