RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF575Q86XF7 245 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD13-201ENST00000392539 HBDP02042 147 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXD13-201ENST00000392539 COX8AP10176 69 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXD13-201ENST00000392539 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXD13-201ENST00000392539 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXD13-201ENST00000392539 CNFNQ9BYD5 112 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXD13-201ENST00000392539 LMO4P61968 165 aa20.39■□□□□ 0.86
HOXD13-201ENST00000392539 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
HOXD13-201ENST00000392539 CLEC19AQ6UXS0 136 aa20.39■□□□□ 0.86
HOXD13-201ENST00000392539 DPF1Q92782 380 aa20.39■□□□□ 0.86
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC140Q96MF4 163 aa20.39■□□□□ 0.86
HOXD13-201ENST00000392539 PRAC2D3DTV9 90 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 NPYP01303 97 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 PCP4P48539 62 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 LGALS9BQ3B8N2 356 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 LGALS9CQ6DKI2 356 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 NBASA2RRP1 2371 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 CLPSL1A2RUU4 121 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 PAX8Q06710 450 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 LINC01559Q495D7 138 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 NPFFO15130 113 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 G3V318 75 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 SMKR1H3BMG3 65 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 PPBPP02775 128 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 RNF182Q8N6D2 247 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 BPESC1Q9GZL8 116 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 IGF2RP11717 2491 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 RNF185Q96GF1 192 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 LINC01548A6NM66 108 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 RBX1P62877 108 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 METTL26Q96S19 204 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 IL17RELQ6ZVW7 336 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 OR1N2Q8NGR9 330 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 MSRB1Q9NZV6 116 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 RELNP78509 3460 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 NHLH1Q02575 133 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 PIP4P2Q8N4L2 257 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 DEFB125Q8N687 156 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 C5orf56Q8N8D9 126 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 MAP1LC3AQ9H492 121 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD13-201ENST00000392539 IFI27L1Q96BM0 104 aa20.33■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 TAX1BP3O14907 124 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 CACNG7P62955 275 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 FXYD7P58549 80 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 PRSS57Q6UWY2 283 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 C2orf91Q6ZV80 131 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 OR4C5Q8NGB2 326 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 COL6A6A6NMZ7 2263 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 ATRXP46100 2492 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 LINC01546A6NGU7 62 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 ATP5G2Q06055 141 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 HIF1ANQ9NWT6 349 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 CDKN1BP46527 198 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM78Q5T7P6 136 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 ATP6V0BQ99437 205 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 U3KQE9 123 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 ANKRD39Q53RE8 183 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 MED13LQ71F56 2210 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 VAMP3Q15836 100 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 CD5LO43866 347 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 C8orf86Q6ZUL3 223 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 MOB4Q9Y3A3 225 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 FGF6P10767 208 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 TNFRSF6BO95407 300 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 LY6DQ14210 128 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXD13-201ENST00000392539 PPIFP30405 207 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 CSMD1Q96PZ7 3565 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 TRAV41A0A0B4J266 112 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 FAM223BA6NKX1 122 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 FAM223AQ8IWN6 122 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 C11orf21Q9P2W6 132 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 SNAI2O43623 268 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM219Q86XT9 240 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 FCER1GP30273 86 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 C19orf54Q5BKX5 351 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 BOD1L2Q8IYS8 172 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM97Q5BJF2 176 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD13-201ENST00000392539 GAS8-AS1O95177 125 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms