RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 DAD1P61803 113 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-204ENST00000367379 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-204ENST00000367379 GAMTQ14353 236 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-204ENST00000367379 OXA1LQ15070 435 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-204ENST00000367379 RRN3P1Q2M238 152 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF767PQ75MW2 155 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-204ENST00000367379 LYZL2Q7Z4W2 148 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-204ENST00000367379 GPR141Q7Z602 305 aa3.17□□□□□ -1.9
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PTPRC-204ENST00000367379 OR4C16Q8NGL9 310 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-204ENST00000367379 GPR82Q96P67 336 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-204ENST00000367379 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
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PTPRC-204ENST00000367379 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM208Q9BTX3 173 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-204ENST00000367379 MAGT1Q9H0U3 335 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-204ENST00000367379 MIXL1Q9H2W2 232 aa3.17□□□□□ -1.9
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PTPRC-204ENST00000367379 RAB2BQ8WUD1 216 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRC-204ENST00000367379 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-204ENST00000367379 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa3.15□□□□□ -1.91
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PTPRC-204ENST00000367379 ZNF98A6NK75 572 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-204ENST00000367379 SYNGR2O43760 224 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-204ENST00000367379 INSP01308 110 aa3.15□□□□□ -1.91
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PTPRC-204ENST00000367379 ZNF709Q8N972 641 aa3.15□□□□□ -1.91
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PTPRC-204ENST00000367379 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa3.15□□□□□ -1.91
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PTPRC-204ENST00000367379 SLC25A22Q9H936 323 aa3.15□□□□□ -1.91
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PTPRC-204ENST00000367379 SMCO3A2RU48 225 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-204ENST00000367379 A8MTW9 85 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-204ENST00000367379 F6UB75 175 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-204ENST00000367379 WRBO00258 174 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-204ENST00000367379 Q1RN00 199 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-204ENST00000367379 PYDC2Q56P42 97 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF493Q6ZR52 646 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-204ENST00000367379 TMED4Q7Z7H5 227 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-204ENST00000367379 C1orf158Q8N1D5 194 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-204ENST00000367379 TOMM5Q8N4H5 51 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-204ENST00000367379 LRTM2Q8N967 370 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-204ENST00000367379 MCFD2Q8NI22 146 aa3.14□□□□□ -1.91
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