RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345015.4

KCNQ1-203, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KCNQ1, Length 304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-203ENST00000345015 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.79□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.79□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 CT45A10P0DMU9 189 aa8.79□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 RANP62826 216 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.79□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 STOML3Q8TAV4 291 aa8.79□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 CMTM2Q8TAZ6 248 aa8.79□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 PHYHIPLQ96FC7 376 aa8.79□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 HYLS1Q96M11 299 aa8.79□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.79□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.79□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 A0A1W2PRE2 83 aa8.78□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 CXorf65A6NEN9 183 aa8.78□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 LYRM9A8MSI8 78 aa8.78□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 C1QBP02746 253 aa8.78□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 GCHFRP30047 84 aa8.78□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF138P52744 262 aa8.78□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.78□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 TCEAL7Q9BRU2 100 aa8.78□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.78□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF492Q9P255 531 aa8.78□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.78□□□□□ -1
KCNQ1-203ENST00000345015 DIRC3C9JPN6 131 aa8.77□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 SMLR1H3BR10 107 aa8.77□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 RAB5CP51148 216 aa8.77□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 FXYD7P58549 80 aa8.77□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 BAP18Q8IXM2 172 aa8.77□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.77□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 C16orf74Q96GX8 76 aa8.77□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM210BQ96KR6 192 aa8.77□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.77□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.76□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 PGPA6NDG6 321 aa8.76□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 K7EQM0 130 aa8.76□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 PFDN1O60925 122 aa8.76□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 FHITP49789 147 aa8.76□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.76□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 TMUB2Q71RG4 321 aa8.76□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 AKAP14Q86UN6 197 aa8.76□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.76□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 LINC01587Q99440 93 aa8.76□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 DKK2Q9UBU2 259 aa8.76□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.76□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.75□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.75□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.75□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 C7orf71A4D174 169 aa8.75□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.75□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.75□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 GPX1P07203 203 aa8.74□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 PPT1P50897 306 aa8.74□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF726P1Q15940 193 aa8.74□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.74□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.74□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 C2CD4CQ8TF44 421 aa8.74□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.74□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 VGLL1Q99990 258 aa8.74□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa8.74□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.73□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 DEFB4AO15263 64 aa8.73□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 ERCC8Q13216 396 aa8.73□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 C12orf74Q32Q52 190 aa8.73□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 Q6AWC8 147 aa8.73□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 SLC51BQ86UW2 128 aa8.73□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 HIST1H2BAQ96A08 127 aa8.73□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 ATG101Q9BSB4 218 aa8.73□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.72□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 LCE6AA0A183 80 aa8.72□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.72□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.72□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 TCRAP04437 139 aa8.72□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.72□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.72□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.72□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 C18orf15Q96N68 181 aa8.72□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.72□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.72□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 EPDR1Q9UM22 224 aa8.72□□□□□ -1.01
KCNQ1-203ENST00000345015 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.71□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 GGTLC3B5MD39 225 aa8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms