RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00477Q96M19 166 aa13.87□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFSF18Q9UNG2 199 aa13.87□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 BIRC6Q9NR09 4857 aa13.86□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa13.86□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLLNB2CW77 178 aa13.86□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 RANP62826 216 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 VGLL1Q99990 258 aa13.86□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q9H3A6 140 aa13.86□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 C7orf71A4D174 169 aa13.85□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 HTN3P15516 51 aa13.85□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRISP2P16562 243 aa13.85□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP6V0CP27449 155 aa13.85□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF493Q6ZR52 646 aa13.85□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 LYPD1Q8N2G4 141 aa13.85□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10G4Q8NGN3 311 aa13.85□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10G9Q8NGN4 311 aa13.85□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10G7Q8NGN6 311 aa13.85□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFAF3Q9BU61 184 aa13.85□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAH10Q8IVF4 4471 aa13.85□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PPV4 95 aa13.84□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTN1A1Q13410 526 aa13.84□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM78Q5T7P6 136 aa13.84□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 PQLC2Q6ZP29 291 aa13.84□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 SH3BGRL3Q9H299 93 aa13.84□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEFB130BP0DP73 79 aa13.83□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEFB130AP0DP74 79 aa13.83□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD300CQ08708 224 aa13.83□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRR9Q5T870 116 aa13.83□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa13.83□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q8TAT8 98 aa13.83□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM210BQ96KR6 192 aa13.83□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 PYGO2Q9BRQ0 406 aa13.83□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF492Q9P255 531 aa13.83□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSN1S1P47710 185 aa13.82□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC28AQ8IWP9 274 aa13.82□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBAKDNA6NC62 111 aa13.81□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 NMBP08949 121 aa13.81□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARL14EPLP0DKL9 152 aa13.81□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF138P52744 262 aa13.81□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 OTORQ9NRC9 128 aa13.81□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 DIRC3C9JPN6 131 aa13.8□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPX1P07203 203 aa13.8□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 STAG3L2P0CL84 134 aa13.8□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 STAG3L3P0CL85 134 aa13.8□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERF2P84101 59 aa13.8□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM88Q6PEY1 159 aa13.8□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00467Q9BRT7 94 aa13.8□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMLR1H3BR10 107 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00612Q8N6U2 182 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 RXFP4Q8TDU9 374 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB24Q969Q5 203 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 HYLS1Q96M11 299 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 FRAS1Q86XX4 4008 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 CBY3A6NI87 242 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARPC5O15511 151 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 MBP02144 154 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 P0DMU3 169 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM231AP0DMU4 169 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM231CP0DMU5 169 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q6ZQT7 251 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGPA6NDG6 321 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNURFLB1AK76 121 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP5G1P05496 136 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP5G3P48201 142 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 SSX7Q7RTT5 188 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 C11orf72Q8NBR9 251 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPH3ALQ9UNE2 315 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 GCHFRP30047 84 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM74A1Q5RGS3 127 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF680Q8NEM1 530 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 CMTM2Q8TAZ6 248 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 SUN5Q8TC36 379 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 F5H768 121 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNG5P63218 68 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 POM121L12Q8N7R1 296 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMED6Q8WW62 240 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYTL1Q9NRR1 136 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF726P1Q15940 193 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 ST6GAL2Q96JF0 529 aa13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms