RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 A0A1B0GW15 77 aa8.61□□□□□ -1.03
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PGA3-201ENST00000325558 IGLC6P0CF74 106 aa8.61□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 ERCC8Q13216 396 aa8.61□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.61□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 BAGE3Q86Y29 109 aa8.61□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 RNF182Q8N6D2 247 aa8.61□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 RNF152Q8N8N0 203 aa8.61□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 VPREB3Q9UKI3 123 aa8.61□□□□□ -1.03
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PGA3-201ENST00000325558 CT45A10P0DMU9 189 aa8.6□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.6□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 Q8N2B8 174 aa8.6□□□□□ -1.03
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PGA3-201ENST00000325558 C20orf173Q96LM9 149 aa8.6□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 Q96MF0 132 aa8.6□□□□□ -1.03
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PGA3-201ENST00000325558 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.6□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 TMEM189A5PLL7 270 aa8.6□□□□□ -1.03
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PGA3-201ENST00000325558 CYB5R2Q6BCY4 276 aa8.6□□□□□ -1.03
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PGA3-201ENST00000325558 Q8N976 141 aa8.6□□□□□ -1.03
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PGA3-201ENST00000325558 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
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PGA3-201ENST00000325558 LINC01559Q495D7 138 aa8.59□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 C10orf99Q6UWK7 81 aa8.59□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 KCNS1Q96KK3 526 aa8.59□□□□□ -1.03
PGA3-201ENST00000325558 SMPXQ9UHP9 88 aa8.59□□□□□ -1.03
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PGA3-201ENST00000325558 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.58□□□□□ -1.04
PGA3-201ENST00000325558 U3KQK5 164 aa8.58□□□□□ -1.04
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PGA3-201ENST00000325558 FOXE3Q13461 319 aa8.57□□□□□ -1.04
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PGA3-201ENST00000325558 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.57□□□□□ -1.04
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PGA3-201ENST00000325558 TM4SF20Q53R12 229 aa8.57□□□□□ -1.04
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PGA3-201ENST00000325558 NRN1Q9NPD7 142 aa8.57□□□□□ -1.04
PGA3-201ENST00000325558 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PGA3-201ENST00000325558 NAV2Q8IVL1 2488 aa8.56□□□□□ -1.04
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PGA3-201ENST00000325558 C16orf92Q96LL3 132 aa8.56□□□□□ -1.04
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PGA3-201ENST00000325558 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.55□□□□□ -1.04
PGA3-201ENST00000325558 REC114Q7Z4M0 266 aa8.55□□□□□ -1.04
PGA3-201ENST00000325558 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa8.55□□□□□ -1.04
PGA3-201ENST00000325558 WFDC11Q8NEX6 87 aa8.55□□□□□ -1.04
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PGA3-201ENST00000325558 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.55□□□□□ -1.04
PGA3-201ENST00000325558 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.54□□□□□ -1.04
PGA3-201ENST00000325558 TMEM213A2RRL7 107 aa8.54□□□□□ -1.04
PGA3-201ENST00000325558 J3QKU1 62 aa8.54□□□□□ -1.04
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PGA3-201ENST00000325558 AMTP48728 403 aa8.54□□□□□ -1.04
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.54□□□□□ -1.04
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PGA3-201ENST00000325558 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.54□□□□□ -1.04
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PGA3-201ENST00000325558 DCANP1Q8TF63 244 aa8.54□□□□□ -1.04
PGA3-201ENST00000325558 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PGA3-201ENST00000325558 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.54□□□□□ -1.04
PGA3-201ENST00000325558 ABCA12Q86UK0 2595 aa8.54□□□□□ -1.04
PGA3-201ENST00000325558 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PGA3-201ENST00000325558 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa8.54□□□□□ -1.04
PGA3-201ENST00000325558 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PGA3-201ENST00000325558 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.54□□□□□ -1.04
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