RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 PIP4P2Q8N4L2 257 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 OR9G4Q8NGQ1 327 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 RPEQ96AT9 228 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 VCX2Q9H322 139 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 ENY2Q9NPA8 101 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 OOSP1A8MZH6 123 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 OR2J3O76001 311 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 COX7A1P24310 79 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 C5orf47Q569G3 176 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 SGK494Q96LW2 274 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 SIRPDQ9H106 197 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 DPM3Q9P2X0 92 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 E9PLD3 99 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 DSCR9P59020 149 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 C10orf105Q8TEF2 133 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 WDR83OSQ9Y284 106 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 DCHS2Q6V1P9 2916 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 OPRK1P41145 380 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 MINOS1Q5TGZ0 78 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 CACNG7P62955 275 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 MIR17HGQ75NE6 70 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF502Q8TBZ5 544 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 MGST2Q99735 147 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF747Q9BV97 191 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 PLEKHA3Q9HB20 300 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 A0A1W2PPI3 338 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 MEIG1Q5JSS6 88 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 OR1L8Q8NGR8 309 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 PRSS46E5RG02 174 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 FNDC10F2Z333 226 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 CRYGBP07316 175 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 VMO1Q7Z5L0 202 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 WFDC3Q8IUB2 231 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 FAM106CPP0CH98 169 aa11.57□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 FAM106AQ4KMX7 169 aa11.57□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 MOB3BQ86TA1 216 aa11.57□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 MPDU1O75352 247 aa11.56□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 DLX1P56177 255 aa11.56□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 C2orf83Q53S99 150 aa11.56□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 FAM162BQ5T6X4 162 aa11.56□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 TREML4Q6UXN2 200 aa11.56□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 PGLYRP4Q96LB8 373 aa11.56□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 GGTLC3B5MD39 225 aa11.56□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 APOHP02749 345 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 TTC32Q5I0X7 151 aa11.56□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 TRAV25A0A0B4J276 109 aa11.56□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa11.56□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 FCER1GP30273 86 aa11.56□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 FLNCQ14315 2725 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 NPIPB6E9PJ23 425 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 UBE2E1P51965 193 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 CFHR4Q92496 578 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 CHAC1Q9BUX1 264 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF462Q96JM2 2506 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 EVI2AP22794 236 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 GAGE2BQ13066 116 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 GAGE2EQ4V326 116 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 CARD19Q96LW7 228 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 GAGE2DQ9UEU5 116 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 ERHP84090 104 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 SIGLEC9Q9Y336 463 aa11.54□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa11.54□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 TRAV4A0A0B4J268 109 aa11.54□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 HBBP68871 147 aa11.54□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 RASL11AQ6T310 242 aa11.54□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 RITA1Q96K30 269 aa11.54□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa11.54□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa11.53□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa11.53□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 TIMM23O14925 209 aa11.53□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 MYOD1P15172 320 aa11.53□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 PAX8Q06710 450 aa11.53□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 NPBQ8NG41 125 aa11.53□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 AGRNO00468 2067 aa11.53□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 CRLF1O75462 422 aa11.53□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 AP5S1Q9NUS5 200 aa11.53□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 AREGP15514 252 aa11.52□□□□□ -0.56
HOXA3-201ENST00000317201 EBI3Q14213 229 aa11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms