RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 RARRES2Q99969 163 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 X6R8D5 127 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 FAM74A7A6NL05 159 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 Q6ZQT7 251 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 CSN1S1P47710 185 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 ATP5G3P48201 142 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 PRR9Q5T870 116 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 LINC00479Q96M42 142 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 A0A0J9YWU9 116 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 A0A1W2PRE2 83 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 PAGE4O60829 102 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 CDKN1BP46527 198 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 RAB5CP51148 216 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 TVP23CQ96ET8 276 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 LINC00477Q96M19 166 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF492Q9P255 531 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 TCRAP04437 139 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 CST9LP1Q5W188 147 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 Q8NAQ8 132 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 EPDR1Q9UM22 224 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 IGLV2-11P01706 119 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF138P52744 262 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 BTN1A1Q13410 526 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 GNG13Q9P2W3 67 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 RBAKDNA6NC62 111 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 KLLNB2CW77 178 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 INSP01308 110 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 IFNA7P01567 189 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 AZU1P20160 251 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 ODF3Q96PU9 254 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 AMBPP02760 352 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 HTN1P15515 57 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 CRISP2P16562 243 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 ATG101Q9BSB4 218 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 F6UZH7 168 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 PEX7O00628 323 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 TSPOP30536 169 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 C8orf49Q96NF6 230 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 TENM2Q9NT68 2774 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 C7orf71A4D174 169 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 GPX1P07203 203 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 LEPP41159 167 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 EMP1P54849 157 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 TEX261Q6UWH6 196 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 PRNTQ86SH4 94 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 LINC01587Q99440 93 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 CELA1Q9UNI1 258 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 PSG8Q9UQ74 426 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 C11orf94C9JXX5 98 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 MIFP14174 115 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 NEU1Q99519 415 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-201ENST00000309641 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 TEX46H3BTG2 121 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 HBE1P02100 147 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-201ENST00000309641 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.52□□□□□ -1.37
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