RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 HLA-DMBP28068 263 aa21.69■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 IGFL4Q6B9Z1 124 aa21.69■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 NBASA2RRP1 2371 aa21.69■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 PPBPP02775 128 aa21.68■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 UBE2E1P51965 193 aa21.68■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 BUB3O43684 328 aa21.68■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 NPYP01303 97 aa21.68■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 VAMP3Q15836 100 aa21.68■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 C2orf91Q6ZV80 131 aa21.68■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 ZNF575Q86XF7 245 aa21.68■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 CD5LO43866 347 aa21.67■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 RHOGP84095 191 aa21.67■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 SLC50A1Q9BRV3 221 aa21.67■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 K7EP13 123 aa21.67■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 GOSR1O95249 250 aa21.67■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 ORM1P02763 201 aa21.67■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa21.67■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 ITPR1Q14643 2758 aa21.66■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 PIEZO1Q92508 2521 aa21.66■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 UQCRFS1P47985 274 aa21.66■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 LINC01559Q495D7 138 aa21.66■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 PIP4P2Q8N4L2 257 aa21.66■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 OR4C5Q8NGB2 326 aa21.65■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 CACNA1AO00555 2505 aa21.65■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 GNLYP22749 145 aa21.65■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 ECSCRQ19T08 205 aa21.65■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 LINC01546A6NGU7 62 aa21.64■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 ATP6V0E1O15342 81 aa21.64■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 CLEC3BP05452 202 aa21.64■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 IFI27L1Q96BM0 104 aa21.64■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 AJUBAQ96IF1 538 aa21.64■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa21.64■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa21.64■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 SMKR1H3BMG3 65 aa21.64■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 FGF6P10767 208 aa21.64■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa21.64■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 RNF185Q96GF1 192 aa21.64■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 MAP1LC3AQ9H492 121 aa21.64■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 CACNG7P62955 275 aa21.63■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 RELNP78509 3460 aa21.63■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 A0A1W2PPR1 153 aa21.62■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD39Q53RE8 183 aa21.62■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 SEC11AP67812 179 aa21.62■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 ERCC8Q13216 396 aa21.62■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa21.61■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 PRAC2D3DTV9 90 aa21.6■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 CLPSL1A2RUU4 121 aa21.6■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 CCDC140Q96MF4 163 aa21.6■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 SAA4P35542 130 aa21.59■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 TMEM97Q5BJF2 176 aa21.59■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 PRSS57Q6UWY2 283 aa21.59■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 BOD1L2Q8IYS8 172 aa21.59■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa21.59■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 MSRB1Q9NZV6 116 aa21.59■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa21.58■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 NDUFS7O75251 213 aa21.58■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 IL17RELQ6ZVW7 336 aa21.58■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 RNF182Q8N6D2 247 aa21.58■■□□□ 1.05
UBP1-201ENST00000283628 EFNA4P52798 201 aa21.57■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 FXYD7P58549 80 aa21.57■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 CLEC19AQ6UXS0 136 aa21.57■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 OR9G4Q8NGQ1 327 aa21.57■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 SIVA1O15304 175 aa21.57■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 HIF1ANQ9NWT6 349 aa21.57■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 CBY3A6NI87 242 aa21.56■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 PSMG4Q5JS54 123 aa21.56■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 METTL26Q96S19 204 aa21.56■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 SNAI2O43623 268 aa21.56■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa21.55■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 TNFRSF6BO95407 300 aa21.55■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 C19orf84I3L1E1 186 aa21.54■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 FCER1GP30273 86 aa21.54■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa21.54■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 FOXE3Q13461 319 aa21.54■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 TMEM78Q5T7P6 136 aa21.54■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 ATP6V0BQ99437 205 aa21.54■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 PKD1L2Q7Z442 2459 aa21.53■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 G3V318 75 aa21.53■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 ERASQ7Z444 233 aa21.53■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 PIFOQ8TCI5 191 aa21.53■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa21.52■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 LMO4P61968 165 aa21.52■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 UBTD1Q9HAC8 227 aa21.52■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 U3KQE9 123 aa21.52■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa21.52■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa21.52■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 C7orf71A4D174 169 aa21.52■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 NPFFO15130 113 aa21.52■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa21.52■■□□□ 1.04
UBP1-201ENST00000283628 A1L4Q6 167 aa21.51■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 LEPP41159 167 aa21.51■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 C5orf56Q8N8D9 126 aa21.51■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 HSD52Q0P140 79 aa21.51■■□□□ 1.03
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